More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2197 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2197  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
402 aa  809    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000180504  hitchhiker  0.0045397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3569  acetyl-CoA acetyltransferase  71.25 
 
 
401 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42090  acetyl-CoA acetyltransferase  71.5 
 
 
401 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2489  acetyl-CoA acetyltransferase  70.65 
 
 
402 aa  591  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2591  acetyl-CoA acetyltransferase  70.75 
 
 
401 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1739  acetyl-CoA acetyltransferase  69.25 
 
 
401 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2753  acetyl-CoA acetyltransferase  68.25 
 
 
401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1470  acetyl-CoA acetyltransferase  67.65 
 
 
404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3015  acetyl-CoA acetyltransferase  69.75 
 
 
401 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554665  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5873  acetyl-CoA acetyltransferase  65 
 
 
401 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10876  acetyl-CoA acetyltransferase  66.34 
 
 
412 aa  545  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0134606  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5668  acetyl-CoA acetyltransferase  67 
 
 
400 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4493  acetyl-CoA acetyltransferase  64.6 
 
 
403 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4580  acetyl-CoA acetyltransferase  64.6 
 
 
403 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5067  acetyl-CoA acetyltransferase  64.36 
 
 
403 aa  532  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4458  acetyl-CoA acetyltransferase  65.5 
 
 
401 aa  534  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.951949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4876  acetyl-CoA acetyltransferase  64.85 
 
 
403 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.038952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4371  acetyl-CoA acetyltransferase  65.17 
 
 
402 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1691  acetyl-CoA acetyltransferase  64.11 
 
 
403 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4563  acetyl-CoA acetyltransferases  64.91 
 
 
403 aa  521  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.274398  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1517  acetyl-CoA acetyltransferase  62.87 
 
 
403 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30250  acetyl-CoA acetyltransferase  64.6 
 
 
403 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.674697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2943  acetyl-CoA acetyltransferase  64.11 
 
 
403 aa  514  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1540  acetyl-CoA acetyltransferase  62.87 
 
 
403 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1186  acetyl-CoA acetyltransferase  62.44 
 
 
402 aa  509  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1504  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 
405 aa  508  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.955606  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0916  acetyl-CoA acetyltransferases  61.14 
 
 
403 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7185  acetyl-CoA acetyltransferase  60.75 
 
 
401 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1538  acetyl-CoA acetyltransferase  60.95 
 
 
402 aa  498  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.697645  normal  0.748727 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1398  acetyl-CoA acetyltransferase  60.7 
 
 
402 aa  496  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4504  acetyl-CoA acetyltransferase  61.63 
 
 
403 aa  497  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0464  acetyl-CoA acetyltransferase  59.9 
 
 
401 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5510  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.35 
 
 
402 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  59.9 
 
 
402 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  59.4 
 
 
401 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4182  acetyl-CoA acetyltransferase  61.69 
 
 
402 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5262  acetyl-CoA acetyltransferase  62.32 
 
 
407 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514343  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3891  acetyl-CoA acetyltransferase  63.16 
 
 
400 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201357  normal  0.156596 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3851  acetyl-CoA acetyltransferase  58.75 
 
 
401 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4032  acetyl-CoA acetyltransferase  58.75 
 
 
402 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126529  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4928  acetyl-CoA acetyltransferase  58.75 
 
 
401 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.5477 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0794  acetyl-CoA acetyltransferase  58.75 
 
 
402 aa  475  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0745  acetyl-CoA acetyltransferase  58.75 
 
 
402 aa  475  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0145  acetyl-CoA acetyltransferase  57.25 
 
 
402 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267922  normal  0.198223 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0341  acetyl-CoA acetyltransferase  60.79 
 
 
403 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3568  acetyl-CoA acetyltransferase  57.75 
 
 
402 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.996401  normal  0.399886 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0074  acetyl-CoA acetyltransferase  58 
 
 
401 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0061  acetyl-CoA acetyltransferase  58.25 
 
 
500 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0022  acetyl-CoA acetyltransferase  58.5 
 
 
402 aa  465  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.899492  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2295  acetyl-CoA acetyltransferase  55.72 
 
 
403 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577319  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3279  acetyl-CoA acetyltransferase  57.25 
 
 
402 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3440  acetyl-CoA acetyltransferase  57 
 
 
402 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2197  acetyl-CoA acetyltransferase  56.22 
 
 
403 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3244  acetyl-CoA acetyltransferase  57.25 
 
 
402 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.0367411 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0542  acetyl-CoA acetyltransferases  57.75 
 
 
401 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0376899  normal  0.0679455 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0872  acetyl-CoA acetyltransferase  56.22 
 
 
403 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0901574  normal  0.206347 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0286  acetyl-CoA acetyltransferase  58 
 
 
617 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0072  acetyl-CoA acetyltransferase  58 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2729  acetyl-CoA acetyltransferase  58 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0242  acetyl-CoA acetyltransferase  56.5 
 
 
402 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904608  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1823  acetyl-CoA acetyltransferase  58 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516733  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5240  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 
402 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4605  acetyl-CoA acetyltransferase  55.25 
 
 
402 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0214  acetyl-CoA acetyltransferase  55.86 
 
 
402 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0003  acetyl-CoA acetyltransferase  56.36 
 
 
402 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0736  acetyl-CoA acetyltransferase  56 
 
 
402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0598  acetyl-CoA acetyltransferase  55.5 
 
 
402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2870  acetyl-CoA acetyltransferase  55.97 
 
 
403 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0805  acetyl-CoA acetyltransferase  56.75 
 
 
402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1657  acetyl-CoA acetyltransferase  54 
 
 
401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0836  acetyl-CoA acetyltransferase  55.36 
 
 
403 aa  442  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.699301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0886  acetyl-CoA acetyltransferase  56.75 
 
 
402 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679182  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  56.5 
 
 
402 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2975  acetyl-CoA acetyltransferase  54.86 
 
 
403 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00597793  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1561  acetyl-CoA acetyltransferase  53.87 
 
 
403 aa  441  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.332281  normal  0.704094 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0281  thiolase  54.77 
 
 
402 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4631  acetyl-CoA acetyltransferase  53.3 
 
 
409 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0090  acetyl-CoA acetyltransferase  47.6 
 
 
414 aa  368  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498673  normal  0.945472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4151  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 
417 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409684  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1244  acetyl-CoA acetyltransferase  48.43 
 
 
415 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.023257  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4830  acetyl-CoA acetyltransferase  47.23 
 
 
417 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1771  acetyl-CoA acetyltransferase  48.2 
 
 
417 aa  359  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3991  acetyl-CoA acetyltransferase  47.48 
 
 
417 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1637  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 
416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.322662  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3619  acetyl-CoA acetyltransferase  47.93 
 
 
412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2746  acetyl-CoA acetyltransferase  47.6 
 
 
410 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.80171  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2349  acetyl-CoA acetyltransferase  46.78 
 
 
415 aa  344  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  46.29 
 
 
383 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  44.78 
 
 
382 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  46.17 
 
 
379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  45.27 
 
 
380 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1534  Acetyl-CoA C-acyltransferase  44.08 
 
 
389 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0678087  normal  0.0334478 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2345  acetyl-CoA acetyltransferase  43.09 
 
 
407 aa  316  5e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  45.43 
 
 
394 aa  315  7e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  43.38 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  43.98 
 
 
385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  42.34 
 
 
391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  44.91 
 
 
392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  44.99 
 
 
399 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3409  acetyl-CoA acetyltransferase  41.94 
 
 
401 aa  308  8e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>