More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0090 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3619  acetyl-CoA acetyltransferase  78.93 
 
 		 412 aa  666    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0090  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 414 aa  849    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498673  normal  0.945472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3991  acetyl-CoA acetyltransferase  71.77 
 
 		 417 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4830  acetyl-CoA acetyltransferase  72.01 
 
 		 417 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4151  acetyl-CoA acetyltransferase  71.29 
 
 		 417 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409684  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2746  acetyl-CoA acetyltransferase  72.64 
 
 		 410 aa  594  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.80171  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2349  acetyl-CoA acetyltransferase  71.29 
 
 		 415 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1771  acetyl-CoA acetyltransferase  70.1 
 
 		 417 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1244  acetyl-CoA acetyltransferase  70.57 
 
 		 415 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.023257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1637  acetyl-CoA acetyltransferase  70.33 
 
 		 416 aa  580  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.322662  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4631  acetyl-CoA acetyltransferase  50.12 
 
 		 409 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2489  acetyl-CoA acetyltransferase  50.97 
 
 		 402 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5668  acetyl-CoA acetyltransferase  50.59 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2753  acetyl-CoA acetyltransferase  48.67 
 
 		 401 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43749  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42090  acetyl-CoA acetyltransferase  50.12 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3569  acetyl-CoA acetyltransferase  49.88 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2591  acetyl-CoA acetyltransferase  48.18 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1739  acetyl-CoA acetyltransferase  48.67 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  48.55 
 
 		 402 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2197  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2197  acetyl-CoA acetyltransferase  47.6 
 
 		 402 aa  368  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000180504  hitchhiker  0.0045397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2295  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3015  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554665  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1470  acetyl-CoA acetyltransferase  49.76 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0872  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 403 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0901574  normal  0.206347 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5873  acetyl-CoA acetyltransferase  47.86 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0341  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1561  acetyl-CoA acetyltransferase  47.22 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.332281  normal  0.704094 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2870  acetyl-CoA acetyltransferase  48.32 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4458  acetyl-CoA acetyltransferase  47.86 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.951949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4504  acetyl-CoA acetyltransferase  47.73 
 
 		 403 aa  363  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5510  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.6 
 
 		 402 aa  359  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7185  acetyl-CoA acetyltransferase  47.6 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1186  acetyl-CoA acetyltransferase  46.14 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1538  acetyl-CoA acetyltransferase  46.86 
 
 		 402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.697645  normal  0.748727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4605  acetyl-CoA acetyltransferase  46.97 
 
 		 402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0805  acetyl-CoA acetyltransferase  47.94 
 
 		 402 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4928  acetyl-CoA acetyltransferase  46.73 
 
 		 401 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.5477 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3851  acetyl-CoA acetyltransferase  46.73 
 
 		 401 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2975  acetyl-CoA acetyltransferase  45.19 
 
 		 403 aa  351  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00597793  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0542  acetyl-CoA acetyltransferases  45.8 
 
 		 401 aa  351  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0376899  normal  0.0679455 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1398  acetyl-CoA acetyltransferase  45.89 
 
 		 402 aa  350  4e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0836  acetyl-CoA acetyltransferase  45.52 
 
 		 403 aa  349  5e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.699301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4493  acetyl-CoA acetyltransferase  46.54 
 
 		 403 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4580  acetyl-CoA acetyltransferase  46.54 
 
 		 403 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0736  acetyl-CoA acetyltransferase  47.22 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3279  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10876  acetyl-CoA acetyltransferase  46.6 
 
 		 412 aa  347  3e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0134606  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0003  acetyl-CoA acetyltransferase  47.22 
 
 		 402 aa  346  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2943  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 		 403 aa  346  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0916  acetyl-CoA acetyltransferases  46.68 
 
 		 403 aa  344  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3440  acetyl-CoA acetyltransferase  46.73 
 
 		 402 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4876  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.038952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0886  acetyl-CoA acetyltransferase  47.24 
 
 		 402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679182  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  44.79 
 
 		 401 aa  342  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4182  acetyl-CoA acetyltransferase  46.17 
 
 		 402 aa  342  5e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  46.73 
 
 		 402 aa  342  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1691  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 		 403 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4371  acetyl-CoA acetyltransferase  46.62 
 
 		 402 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3244  acetyl-CoA acetyltransferase  46.25 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.0367411 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0794  acetyl-CoA acetyltransferase  44.6 
 
 		 402 aa  341  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0745  acetyl-CoA acetyltransferase  44.6 
 
 		 402 aa  341  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3568  acetyl-CoA acetyltransferase  46.49 
 
 		 402 aa  341  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.996401  normal  0.399886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4563  acetyl-CoA acetyltransferases  46.27 
 
 		 403 aa  339  5e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.274398  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5240  acetyl-CoA acetyltransferase  46.49 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0145  acetyl-CoA acetyltransferase  45.52 
 
 		 402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267922  normal  0.198223 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4032  acetyl-CoA acetyltransferase  44.36 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0061  acetyl-CoA acetyltransferase  46 
 
 		 500 aa  335  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5067  acetyl-CoA acetyltransferase  45.39 
 
 		 403 aa  334  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1657  acetyl-CoA acetyltransferase  45.01 
 
 		 401 aa  333  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0074  acetyl-CoA acetyltransferase  45.56 
 
 		 401 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0464  acetyl-CoA acetyltransferase  42.38 
 
 		 401 aa  332  7.000000000000001e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1504  acetyl-CoA acetyltransferase  46.47 
 
 		 405 aa  329  6e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.955606  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0281  thiolase  45.08 
 
 		 402 aa  328  9e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1517  acetyl-CoA acetyltransferase  45.11 
 
 		 403 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1540  acetyl-CoA acetyltransferase  45.11 
 
 		 403 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0214  acetyl-CoA acetyltransferase  43.34 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0022  acetyl-CoA acetyltransferase  46 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.899492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0286  acetyl-CoA acetyltransferase  45.56 
 
 		 617 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0598  acetyl-CoA acetyltransferase  43.1 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2729  acetyl-CoA acetyltransferase  45.56 
 
 		 401 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1823  acetyl-CoA acetyltransferase  45.56 
 
 		 401 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516733  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0072  acetyl-CoA acetyltransferase  45.56 
 
 		 401 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5262  acetyl-CoA acetyltransferase  47.53 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0242  acetyl-CoA acetyltransferase  42.62 
 
 		 402 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3891  acetyl-CoA acetyltransferase  46.25 
 
 		 400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201357  normal  0.156596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30250  acetyl-CoA acetyltransferase  45.35 
 
 		 403 aa  316  4e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.674697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  43.71 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  42.58 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  41.43 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  42.21 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  42.14 
 
 		 423 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  42.21 
 
 		 392 aa  277  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  39.95 
 
 		 397 aa  276  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2345  acetyl-CoA acetyltransferase  39.31 
 
 		 407 aa  276  7e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  41.49 
 
 		 392 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  42.08 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  41.33 
 
 		 397 aa  272  9e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.56 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  41.2 
 
 		 395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>