More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1534 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1534  Acetyl-CoA C-acyltransferase  100 
 
 
389 aa  771    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0678087  normal  0.0334478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2943  acetyl-CoA acetyltransferase  46.87 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4493  acetyl-CoA acetyltransferase  47.13 
 
 
403 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4580  acetyl-CoA acetyltransferase  47.13 
 
 
403 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10876  acetyl-CoA acetyltransferase  45.39 
 
 
412 aa  323  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0134606  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4876  acetyl-CoA acetyltransferase  46.38 
 
 
403 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.038952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2489  acetyl-CoA acetyltransferase  43.32 
 
 
402 aa  323  4e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1691  acetyl-CoA acetyltransferase  45.39 
 
 
403 aa  323  5e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2197  acetyl-CoA acetyltransferase  44.08 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000180504  hitchhiker  0.0045397 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5873  acetyl-CoA acetyltransferase  45.84 
 
 
401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2591  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 
401 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5067  acetyl-CoA acetyltransferase  44.89 
 
 
403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1470  acetyl-CoA acetyltransferase  45.75 
 
 
404 aa  319  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4371  acetyl-CoA acetyltransferase  46.13 
 
 
402 aa  315  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42090  acetyl-CoA acetyltransferase  44.08 
 
 
401 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0916  acetyl-CoA acetyltransferases  43.97 
 
 
403 aa  311  9e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3569  acetyl-CoA acetyltransferase  44.08 
 
 
401 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1517  acetyl-CoA acetyltransferase  44.64 
 
 
403 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1540  acetyl-CoA acetyltransferase  44.64 
 
 
403 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4504  acetyl-CoA acetyltransferase  43.11 
 
 
403 aa  310  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2753  acetyl-CoA acetyltransferase  43.11 
 
 
401 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43749  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30250  acetyl-CoA acetyltransferase  44.86 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.674697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1739  acetyl-CoA acetyltransferase  43.83 
 
 
401 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  40.05 
 
 
401 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2295  acetyl-CoA acetyltransferase  42.61 
 
 
403 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577319  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0341  acetyl-CoA acetyltransferase  44 
 
 
403 aa  299  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0872  acetyl-CoA acetyltransferase  42.36 
 
 
403 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0901574  normal  0.206347 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2197  acetyl-CoA acetyltransferase  42.11 
 
 
403 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747444  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3851  acetyl-CoA acetyltransferase  42.25 
 
 
401 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4928  acetyl-CoA acetyltransferase  42.25 
 
 
401 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.5477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5668  acetyl-CoA acetyltransferase  42.32 
 
 
400 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4563  acetyl-CoA acetyltransferases  41.96 
 
 
403 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.274398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0074  acetyl-CoA acetyltransferase  42.5 
 
 
401 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0464  acetyl-CoA acetyltransferase  40.66 
 
 
401 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0281  thiolase  42.11 
 
 
402 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3015  acetyl-CoA acetyltransferase  42.82 
 
 
401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554665  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2729  acetyl-CoA acetyltransferase  42.5 
 
 
401 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3279  acetyl-CoA acetyltransferase  40.95 
 
 
402 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0072  acetyl-CoA acetyltransferase  42.5 
 
 
401 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1823  acetyl-CoA acetyltransferase  42.5 
 
 
401 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516733  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4182  acetyl-CoA acetyltransferase  42.86 
 
 
402 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0061  acetyl-CoA acetyltransferase  42 
 
 
500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0286  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
617 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2870  acetyl-CoA acetyltransferase  40.35 
 
 
403 aa  285  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4458  acetyl-CoA acetyltransferase  42.82 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.951949 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3568  acetyl-CoA acetyltransferase  40.5 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.996401  normal  0.399886 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1398  acetyl-CoA acetyltransferase  38.94 
 
 
402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  39.8 
 
 
402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7185  acetyl-CoA acetyltransferase  43.32 
 
 
401 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1538  acetyl-CoA acetyltransferase  38.19 
 
 
402 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.697645  normal  0.748727 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0542  acetyl-CoA acetyltransferases  38.44 
 
 
401 aa  282  8.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0376899  normal  0.0679455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1657  acetyl-CoA acetyltransferase  40.75 
 
 
401 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3244  acetyl-CoA acetyltransferase  40.25 
 
 
402 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.0367411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3891  acetyl-CoA acetyltransferase  43.83 
 
 
400 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201357  normal  0.156596 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5510  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.95 
 
 
402 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1186  acetyl-CoA acetyltransferase  38.79 
 
 
402 aa  278  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5240  acetyl-CoA acetyltransferase  39.7 
 
 
402 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0003  acetyl-CoA acetyltransferase  40.75 
 
 
402 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0836  acetyl-CoA acetyltransferase  38.85 
 
 
403 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.699301 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0794  acetyl-CoA acetyltransferase  38.19 
 
 
402 aa  276  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0745  acetyl-CoA acetyltransferase  38.19 
 
 
402 aa  276  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4032  acetyl-CoA acetyltransferase  37.69 
 
 
402 aa  275  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1504  acetyl-CoA acetyltransferase  40.7 
 
 
405 aa  275  9e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.955606  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3440  acetyl-CoA acetyltransferase  39.75 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0736  acetyl-CoA acetyltransferase  37.69 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1561  acetyl-CoA acetyltransferase  38.6 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.332281  normal  0.704094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0242  acetyl-CoA acetyltransferase  37.28 
 
 
402 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904608  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0598  acetyl-CoA acetyltransferase  37.53 
 
 
402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0214  acetyl-CoA acetyltransferase  37.78 
 
 
402 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0145  acetyl-CoA acetyltransferase  37.53 
 
 
402 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267922  normal  0.198223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4605  acetyl-CoA acetyltransferase  36.68 
 
 
402 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2975  acetyl-CoA acetyltransferase  39.1 
 
 
403 aa  269  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00597793  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5262  acetyl-CoA acetyltransferase  41.34 
 
 
407 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514343  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4631  acetyl-CoA acetyltransferase  41.65 
 
 
409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0022  acetyl-CoA acetyltransferase  37.44 
 
 
402 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.899492  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0805  acetyl-CoA acetyltransferase  36.93 
 
 
402 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0886  acetyl-CoA acetyltransferase  36.93 
 
 
402 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679182  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  36.18 
 
 
402 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1244  acetyl-CoA acetyltransferase  40.05 
 
 
415 aa  259  7e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.023257  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2746  acetyl-CoA acetyltransferase  39.9 
 
 
410 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.80171  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1771  acetyl-CoA acetyltransferase  40.58 
 
 
417 aa  257  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4151  acetyl-CoA acetyltransferase  39.13 
 
 
417 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409684  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3991  acetyl-CoA acetyltransferase  39.86 
 
 
417 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0090  acetyl-CoA acetyltransferase  37.68 
 
 
414 aa  246  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498673  normal  0.945472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4830  acetyl-CoA acetyltransferase  38.41 
 
 
417 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1637  acetyl-CoA acetyltransferase  38.98 
 
 
416 aa  245  8e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.322662  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1005  Acetyl-CoA C-acyltransferase  41.12 
 
 
386 aa  241  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2349  acetyl-CoA acetyltransferase  37.02 
 
 
415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3619  acetyl-CoA acetyltransferase  38.41 
 
 
412 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  38.71 
 
 
385 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  34.85 
 
 
382 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  37.04 
 
 
390 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  38.19 
 
 
381 aa  222  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  39.6 
 
 
399 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  37.65 
 
 
391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  37.41 
 
 
423 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  37.78 
 
 
395 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  38.25 
 
 
395 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  36.78 
 
 
392 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  35.18 
 
 
383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>