58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1754 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1940  transposase  95.07 
 
 		 1257 bp  1992    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0399155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1410  transposase  94.51 
 
 		 1185 bp  1118    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00377453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1277    99.41 
 
 		 341 bp  660    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1543  transposase  95.07 
 
 		 1257 bp  1992    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1209    94.88 
 
 		 1354 bp  2028    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1055  transposase  95.85 
 
 		 891 bp  1457    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0942    97.02 
 
 		 872 bp  1522    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.397014  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0867    98.83 
 
 		 341 bp  644    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00963777  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0806    96.25 
 
 		 609 bp  932    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0500044  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1754    100 
 
 		 5389 bp  10680    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0763  hypothetical protein  97.69 
 
 		 867 bp  1544    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.250841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0560  transposase  95.07 
 
 		 1257 bp  1992    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0505  transposase  95.07 
 
 		 1257 bp  1992    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0463  transposase  94.99 
 
 		 1257 bp  1984    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0188    96.56 
 
 		 495 bp  795    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.76911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1853  transposase  95.07 
 
 		 1257 bp  1992    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1760  transposase  100 
 
 		 459 bp  910    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1759  transposase  100 
 
 		 339 bp  672    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0003  transposase  95.07 
 
 		 1257 bp  1992    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0016  transposase  97.58 
 
 		 537 bp  954    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0017    99.12 
 
 		 339 bp  648    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0018  transposase  97.65 
 
 		 489 bp  763    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0151  transposase  97.61 
 
 		 1257 bp  2246    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0101  transposase  98.12 
 
 		 489 bp  779    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0138  transposase  95.15 
 
 		 1257 bp  2000    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0055  IS861, transposase (orf1), IS3 family, truncated  96.68 
 
 		 519 bp  613  9.999999999999999e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1757  transposase  100 
 
 		 285 bp  565  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0364    96.55 
 
 		 588 bp  545  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0764    96.67 
 
 		 303 bp  515  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0254    90.88 
 
 		 516 bp  440  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0102    95.83 
 
 		 264 bp  436  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0900    86.57 
 
 		 796 bp  432  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00475035  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1418  transposase  95.13 
 
 		 267 bp  418  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1380    85.24 
 
 		 507 bp  420  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  83.06 
 
 		 837 bp  410  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0291  transposase  87.06 
 
 		 489 bp  406  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0515999  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1758  transposase  100 
 
 		 189 bp  375  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1419  transposase  97.14 
 
 		 210 bp  361  1e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0365  transposase  98.41 
 
 		 189 bp  351  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0056    92.46 
 
 		 609 bp  345  8e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0255    92.55 
 
 		 279 bp  258  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.384648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0366  transposase  91.18 
 
 		 192 bp  218  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0785    96.36 
 
 		 222 bp  186  4.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000127878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1852  hypothetical protein  97.53 
 
 		 147 bp  145  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000254084  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0044    85.47 
 
 		 655 bp  143  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1250    89.9 
 
 		 129 bp  113  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0290  transposase  93.33 
 
 		 147 bp  103  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174922  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1067  IS861, transposase OrfA  80.17 
 
 		 537 bp  97.6  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000711347  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1526  IS861, transposase OrfA  80.17 
 
 		 537 bp  97.6  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.437319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1373    86.21 
 
 		 189 bp  95.6  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1417  IS861, transposase (orf2), IS3 family, truncated  78.97 
 
 		 639 bp  91.7  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1654  hypothetical protein  94.74 
 
 		 111 bp  89.7  0.000000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  81.99 
 
 		 834 bp  89.7  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  81.37 
 
 		 834 bp  81.8  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1360  transposase  85.56 
 
 		 510 bp  75.8  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.452785  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1256    93.02 
 
 		 429 bp  61.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1691  hypothetical protein  100 
 
 		 198 bp  60  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1692  transposase  91.3 
 
 		 1329 bp  60  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.67531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>