22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0188 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1940  transposase  93.55 
 
 
1257 bp  684    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0399155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0138  transposase  95.91 
 
 
1257 bp  771    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0151  transposase  95.48 
 
 
1257 bp  755    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0188    100 
 
 
495 bp  981    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.76911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0463  transposase  93.55 
 
 
1257 bp  684    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0505  transposase  93.55 
 
 
1257 bp  684    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0560  transposase  93.55 
 
 
1257 bp  684    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1853  transposase  93.55 
 
 
1257 bp  684    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1754    96.56 
 
 
5389 bp  795    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0003  transposase  93.55 
 
 
1257 bp  684    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1543  transposase  93.55 
 
 
1257 bp  684    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1055  transposase  94.19 
 
 
891 bp  708    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1410  transposase  93.16 
 
 
1185 bp  652    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00377453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0764    94.33 
 
 
303 bp  460  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1380    91.35 
 
 
507 bp  240  3e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0867    92.04 
 
 
341 bp  153  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00963777  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1277    92.04 
 
 
341 bp  153  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0942    98.77 
 
 
872 bp  153  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.397014  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0763  hypothetical protein  98.77 
 
 
867 bp  153  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.250841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0785    90.65 
 
 
222 bp  133  5.0000000000000004e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000127878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1250    84.85 
 
 
129 bp  73.8  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0044    88.71 
 
 
655 bp  67.9  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>