22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0867 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1754    98.83 
 
 
5389 bp  644    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1277    98.83 
 
 
341 bp  644    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0867    100 
 
 
341 bp  676    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00963777  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0763  hypothetical protein  93.52 
 
 
867 bp  317  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.250841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0151  transposase  93.06 
 
 
1257 bp  309  3e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1055  transposase  93.06 
 
 
891 bp  309  3e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1940  transposase  92.59 
 
 
1257 bp  301  7e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0399155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0003  transposase  92.59 
 
 
1257 bp  301  7e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1853  transposase  92.59 
 
 
1257 bp  301  7e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1543  transposase  92.59 
 
 
1257 bp  301  7e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1410  transposase  92.59 
 
 
1185 bp  301  7e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00377453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0560  transposase  92.59 
 
 
1257 bp  301  7e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0505  transposase  92.59 
 
 
1257 bp  301  7e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0463  transposase  92.59 
 
 
1257 bp  301  7e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0942    92.13 
 
 
872 bp  285  4.0000000000000003e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.397014  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0138  transposase  90.77 
 
 
1257 bp  244  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1380    87 
 
 
507 bp  212  5e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0785    96.36 
 
 
222 bp  186  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000127878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0188    92.04 
 
 
495 bp  153  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.76911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0044    85.03 
 
 
655 bp  133  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0764    88.14 
 
 
303 bp  123  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1250    90.91 
 
 
129 bp  121  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>