19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1380 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1380    100 
 
 
507 bp  1005    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0151  transposase  85.63 
 
 
1257 bp  444  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1055  transposase  85.24 
 
 
891 bp  422  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1754    85.24 
 
 
5389 bp  420  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0003  transposase  85.04 
 
 
1257 bp  414  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1940  transposase  85.04 
 
 
1257 bp  414  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0399155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0463  transposase  85.04 
 
 
1257 bp  414  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0505  transposase  85.04 
 
 
1257 bp  414  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0560  transposase  85.04 
 
 
1257 bp  414  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1853  transposase  85.04 
 
 
1257 bp  414  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1543  transposase  85.04 
 
 
1257 bp  414  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0138  transposase  84.82 
 
 
1257 bp  394  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0763  hypothetical protein  84.67 
 
 
867 bp  315  6.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.250841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0942    84.42 
 
 
872 bp  299  4e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.397014  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0044    91.4 
 
 
655 bp  242  8e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0188    91.35 
 
 
495 bp  240  3e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.76911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1410  transposase  85.77 
 
 
1185 bp  216  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00377453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0867    87 
 
 
341 bp  212  7e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00963777  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1277    86.1 
 
 
341 bp  196  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>