19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0942 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1940  transposase  95.42 
 
 
1257 bp  1405    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0399155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0138  transposase  94.62 
 
 
1257 bp  1350    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0151  transposase  97.59 
 
 
1257 bp  1556    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1853  transposase  95.42 
 
 
1257 bp  1405    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0463  transposase  95.3 
 
 
1257 bp  1398    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0505  transposase  95.42 
 
 
1257 bp  1405    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0560  transposase  95.42 
 
 
1257 bp  1405    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0763  hypothetical protein  97.81 
 
 
867 bp  1552    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.250841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0003  transposase  95.42 
 
 
1257 bp  1405    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0942    100 
 
 
872 bp  1729    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.397014  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1055  transposase  96.65 
 
 
891 bp  854    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1754    97.02 
 
 
5389 bp  1522    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1410  transposase  94.09 
 
 
1185 bp  1094    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00377453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1543  transposase  95.42 
 
 
1257 bp  1405    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1380    84.42 
 
 
507 bp  299  7e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0867    92.13 
 
 
341 bp  285  1e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00963777  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1277    91.2 
 
 
341 bp  270  5.999999999999999e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0044    85.64 
 
 
655 bp  159  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0188    98.77 
 
 
495 bp  153  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.76911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>