19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0785 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0785    100 
 
 
222 bp  440  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000127878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1754    96.36 
 
 
5389 bp  186  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1277    96.36 
 
 
341 bp  186  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0867    96.36 
 
 
341 bp  186  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00963777  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0188    90.65 
 
 
495 bp  133  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.76911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1940  transposase  88.79 
 
 
1257 bp  117  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0399155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0003  transposase  88.79 
 
 
1257 bp  117  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1853  transposase  88.79 
 
 
1257 bp  117  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1543  transposase  88.79 
 
 
1257 bp  117  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0560  transposase  88.79 
 
 
1257 bp  117  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0505  transposase  88.79 
 
 
1257 bp  117  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0463  transposase  88.79 
 
 
1257 bp  117  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1250    87.29 
 
 
129 bp  111  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1055  transposase  87.85 
 
 
891 bp  109  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0138  transposase  87.85 
 
 
1257 bp  109  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0764    86.92 
 
 
303 bp  101  8e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1410  transposase  86.92 
 
 
1185 bp  101  8e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00377453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0151  transposase  86.92 
 
 
1257 bp  101  8e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0044    90.7 
 
 
655 bp  54  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>