18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1250 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1250    100 
 
 
129 bp  256  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0867    90.91 
 
 
341 bp  121  4.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00963777  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1754    89.9 
 
 
5389 bp  113  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1277    89.9 
 
 
341 bp  113  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0785    87.29 
 
 
222 bp  111  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000127878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0188    84.85 
 
 
495 bp  73.8  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.76911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1940  transposase  84 
 
 
1257 bp  67.9  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0399155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0003  transposase  84 
 
 
1257 bp  67.9  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1853  transposase  84 
 
 
1257 bp  67.9  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1543  transposase  84 
 
 
1257 bp  67.9  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0560  transposase  84 
 
 
1257 bp  67.9  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0505  transposase  84 
 
 
1257 bp  67.9  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0463  transposase  84 
 
 
1257 bp  67.9  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1055  transposase  83 
 
 
891 bp  60  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0138  transposase  83 
 
 
1257 bp  60  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0764    81.82 
 
 
303 bp  50.1  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1410  transposase  81.82 
 
 
1185 bp  50.1  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00377453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0151  transposase  81.82 
 
 
1257 bp  50.1  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>