33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1209 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1760  transposase  95.08 
 
 
459 bp  674    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1754    94.88 
 
 
5389 bp  2028    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1209    100 
 
 
1354 bp  2684    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0016  transposase  91.43 
 
 
537 bp  692    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0018  transposase  95.27 
 
 
489 bp  775    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0806    94.47 
 
 
609 bp  908    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0500044  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0101  transposase  96.09 
 
 
489 bp  807    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0017    98.53 
 
 
339 bp  632  1e-179  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1759  transposase  98.23 
 
 
339 bp  624  1e-176  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0364    97.81 
 
 
588 bp  577  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0102    97.35 
 
 
264 bp  468  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  83.36 
 
 
837 bp  448  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0291  transposase  86.63 
 
 
489 bp  442  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0515999  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0056    92.47 
 
 
609 bp  404  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1418  transposase  94.38 
 
 
267 bp  402  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0900    85.57 
 
 
796 bp  387  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00475035  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1758  transposase  98.94 
 
 
189 bp  359  1e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0365  transposase  98.41 
 
 
189 bp  351  3e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0055  IS861, transposase (orf1), IS3 family, truncated  87.26 
 
 
519 bp  343  8e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1757  transposase  87.72 
 
 
285 bp  287  4.0000000000000003e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0366  transposase  93.12 
 
 
192 bp  272  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0255    92.55 
 
 
279 bp  258  4.0000000000000004e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.384648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0254    82.87 
 
 
516 bp  190  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1419  transposase  84.29 
 
 
210 bp  147  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1360  transposase  81.55 
 
 
510 bp  107  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.452785  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1067  IS861, transposase OrfA  80.17 
 
 
537 bp  97.6  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000711347  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1526  IS861, transposase OrfA  80.17 
 
 
537 bp  97.6  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.437319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0290  transposase  92 
 
 
147 bp  95.6  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174922  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1373    85.34 
 
 
189 bp  87.7  0.000000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  79.72 
 
 
834 bp  79.8  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1417  IS861, transposase (orf2), IS3 family, truncated  87.18 
 
 
639 bp  75.8  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  88.24 
 
 
834 bp  71.9  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1256    93.02 
 
 
429 bp  61.9  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>