31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0900 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0900    100 
 
 
796 bp  1578    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00475035  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0291  transposase  92.16 
 
 
489 bp  545  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0515999  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0806    86.75 
 
 
609 bp  446  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0500044  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1754    86.57 
 
 
5389 bp  432  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  85.94 
 
 
837 bp  414  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1209    85.57 
 
 
1354 bp  387  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0018  transposase  85.78 
 
 
489 bp  339  7e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0101  transposase  85.78 
 
 
489 bp  339  7e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1760  transposase  85.29 
 
 
459 bp  323  3.9999999999999996e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0364    90.2 
 
 
588 bp  236  8.000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0254    90.21 
 
 
516 bp  230  5.0000000000000005e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0056    88.41 
 
 
609 bp  210  5e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0255    88.27 
 
 
279 bp  182  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.384648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0017    96.15 
 
 
339 bp  115  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1417  IS861, transposase (orf2), IS3 family, truncated  80.22 
 
 
639 bp  111  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0290  transposase  93.1 
 
 
147 bp  109  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174922  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1759  transposase  94.87 
 
 
339 bp  107  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0016  transposase  81.28 
 
 
537 bp  97.6  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  82.61 
 
 
834 bp  95.6  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1373    86.49 
 
 
189 bp  93.7  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  83.85 
 
 
834 bp  91.7  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0102    92.31 
 
 
264 bp  91.7  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1757  transposase  93.1 
 
 
285 bp  83.8  0.00000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1360  transposase  94.34 
 
 
510 bp  81.8  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.452785  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1418  transposase  87.95 
 
 
267 bp  81.8  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0055  IS861, transposase (orf1), IS3 family, truncated  92.86 
 
 
519 bp  79.8  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1419  transposase  89.71 
 
 
210 bp  79.8  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1067  IS861, transposase OrfA  91.53 
 
 
537 bp  77.8  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000711347  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1526  IS861, transposase OrfA  91.53 
 
 
537 bp  77.8  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.437319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0366  transposase  92 
 
 
192 bp  67.9  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1256    97.14 
 
 
429 bp  61.9  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>