15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0254 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0055  IS861, transposase (orf1), IS3 family, truncated  92.41 
 
 		 519 bp  710    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0254    100 
 
 		 516 bp  1023    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0016  transposase  93.04 
 
 		 537 bp  513  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1754    90.88 
 
 		 5389 bp  440  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1757  transposase  97.07 
 
 		 285 bp  418  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1419  transposase  97.79 
 
 		 210 bp  327  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0807    96.43 
 
 		 168 bp  285  6.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0608135  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0900    90.21 
 
 		 796 bp  230  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00475035  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0366  transposase  89.95 
 
 		 192 bp  224  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1209    82.87 
 
 		 1354 bp  190  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1360  transposase  80.76 
 
 		 510 bp  188  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.452785  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1418  transposase  95 
 
 		 267 bp  127  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0290  transposase  95.65 
 
 		 147 bp  75.8  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174922  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1067  IS861, transposase OrfA  78.89 
 
 		 537 bp  56  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000711347  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1526  IS861, transposase OrfA  78.89 
 
 		 537 bp  56  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.437319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>