27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0364 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0056    94.26 
 
 		 609 bp  692    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0364    100 
 
 		 588 bp  1166    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1209    97.81 
 
 		 1354 bp  577  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0017    96.87 
 
 		 339 bp  553  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1759  transposase  96.55 
 
 		 339 bp  545  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1754    96.55 
 
 		 5389 bp  545  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0102    99.59 
 
 		 264 bp  476  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0018  transposase  95.85 
 
 		 489 bp  438  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0806    95.72 
 
 		 609 bp  422  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0500044  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0101  transposase  94.72 
 
 		 489 bp  414  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0255    93.86 
 
 		 279 bp  410  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.384648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1760  transposase  94.84 
 
 		 459 bp  392  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0291  transposase  94.3 
 
 		 489 bp  349  6e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0515999  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  90.75 
 
 		 837 bp  283  3e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0900    90.2 
 
 		 796 bp  236  6e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00475035  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1417  IS861, transposase (orf2), IS3 family, truncated  81.97 
 
 		 639 bp  101  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  88.75 
 
 		 834 bp  87.7  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0290  transposase  100 
 
 		 147 bp  87.7  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174922  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  87.5 
 
 		 834 bp  79.8  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1373    89.47 
 
 		 189 bp  65.9  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0365  transposase  100 
 
 		 189 bp  50.1  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0016  transposase  100 
 
 		 537 bp  50.1  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1758  transposase  100 
 
 		 189 bp  50.1  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  87.5 
 
 		 804 bp  48.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  87.5 
 
 		 804 bp  48.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  87.5 
 
 		 750 bp  48.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  87.5 
 
 		 750 bp  48.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>