More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1578 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0045  ATPase  74.4 
 
 		 745 aa  1038    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1303  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  77.52 
 
 		 702 aa  1111    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0310613  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2624  ATPase  63.84 
 
 		 701 aa  914    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0572  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  73.24 
 
 		 720 aa  1059    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.544147  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0150  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  75.46 
 
 		 716 aa  1038    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1578  ATP-dependent proteinase ATP-binding subunit  100 
 
 		 699 aa  1415    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2571  ATPase  63.84 
 
 		 701 aa  914    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1327  ATPase  50.83 
 
 		 734 aa  625  1e-178  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00363395  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  52.35 
 
 		 722 aa  627  1e-178  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0640  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  48.83 
 
 		 726 aa  622  1e-177  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.680329  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0571  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  50.46 
 
 		 684 aa  613  9.999999999999999e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0889  ATPase AAA-2 domain protein  50.46 
 
 		 725 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000179007  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0578  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  49.22 
 
 		 748 aa  605  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0684  ATPase AAA-2 domain protein  49.38 
 
 		 841 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0648  ATP-dependent Clp protease  50.16 
 
 		 752 aa  593  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1763  ATPase AAA-2 domain protein  51.26 
 
 		 712 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0488  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  49.22 
 
 		 753 aa  585  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00725796  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  48.37 
 
 		 819 aa  586  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  47.38 
 
 		 810 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  48.62 
 
 		 812 aa  581  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  48.16 
 
 		 818 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  48.16 
 
 		 818 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  47.38 
 
 		 811 aa  578  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  46.96 
 
 		 814 aa  580  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  47.07 
 
 		 817 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  48.06 
 
 		 829 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  47.25 
 
 		 815 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_56  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  46.9 
 
 		 824 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  47.94 
 
 		 818 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  46.87 
 
 		 812 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  46.83 
 
 		 834 aa  571  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  45.35 
 
 		 826 aa  571  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  45.82 
 
 		 812 aa  568  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2116  ATPase AAA-2 domain protein  47.63 
 
 		 781 aa  571  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  46.85 
 
 		 848 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0312  ATPase AAA-2  48.71 
 
 		 803 aa  568  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  46.49 
 
 		 824 aa  565  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  46.72 
 
 		 810 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  44.82 
 
 		 810 aa  568  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  46.64 
 
 		 829 aa  567  1e-160  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  47.99 
 
 		 837 aa  567  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  46.5 
 
 		 828 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1809  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  46.1 
 
 		 705 aa  568  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000172721  hitchhiker  0.000000000383819 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1220  ATPase  48.55 
 
 		 812 aa  567  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0051  ATPase  46.29 
 
 		 824 aa  568  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00486444  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  47.13 
 
 		 846 aa  567  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  44.84 
 
 		 823 aa  566  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  47.87 
 
 		 812 aa  567  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  47.39 
 
 		 812 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  48.89 
 
 		 816 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  47.3 
 
 		 824 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  48.15 
 
 		 812 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  46.61 
 
 		 868 aa  565  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  46.83 
 
 		 835 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3203  ATPase AAA-2 domain protein  47.67 
 
 		 853 aa  563  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  47.35 
 
 		 839 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  46.73 
 
 		 847 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  45.11 
 
 		 791 aa  561  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  48.31 
 
 		 826 aa  561  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.8 
 
 		 862 aa  558  1e-158  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0804  ATPase AAA-2 domain protein  46.69 
 
 		 676 aa  561  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  46.44 
 
 		 842 aa  561  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  47 
 
 		 844 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  45.43 
 
 		 825 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  46.38 
 
 		 841 aa  559  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  48.82 
 
 		 840 aa  561  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  46.51 
 
 		 869 aa  559  1e-158  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  45.67 
 
 		 854 aa  561  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  46.21 
 
 		 844 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  47 
 
 		 836 aa  561  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2062  ATPase AAA-2 domain protein  46.71 
 
 		 847 aa  560  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.587119  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  45.31 
 
 		 852 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  44.88 
 
 		 830 aa  557  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  47.6 
 
 		 814 aa  556  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  45.65 
 
 		 866 aa  556  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  46.32 
 
 		 824 aa  556  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  44.27 
 
 		 879 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  45.98 
 
 		 837 aa  557  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1392  ATPase  44.83 
 
 		 791 aa  556  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  44.41 
 
 		 879 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  47.43 
 
 		 848 aa  556  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13220  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  45.08 
 
 		 862 aa  555  1e-157  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  46.34 
 
 		 850 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3068  ATP-dependent chaperone ClpB  46 
 
 		 887 aa  558  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  46.33 
 
 		 830 aa  558  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  46.06 
 
 		 858 aa  558  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  44.86 
 
 		 855 aa  558  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  46.41 
 
 		 847 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  45.47 
 
 		 852 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  47.19 
 
 		 851 aa  555  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  46.09 
 
 		 823 aa  555  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  46.83 
 
 		 834 aa  555  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  43.03 
 
 		 879 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  47.53 
 
 		 834 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  47.39 
 
 		 851 aa  554  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3818  ATPase  48.81 
 
 		 857 aa  553  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1494  ATPase  45.78 
 
 		 830 aa  554  1e-156  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000400156  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  46.73 
 
 		 811 aa  552  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  46.22 
 
 		 824 aa  548  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  48.64 
 
 		 886 aa  550  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>