More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2624 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1303  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  63.55 
 
 
702 aa  919    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0310613  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0045  ATPase  62.09 
 
 
745 aa  883    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2624  ATPase  100 
 
 
701 aa  1424    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0572  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  63.1 
 
 
720 aa  919    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.544147  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0150  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  65.21 
 
 
716 aa  928    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2571  ATPase  100 
 
 
701 aa  1424    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1578  ATP-dependent proteinase ATP-binding subunit  64.23 
 
 
699 aa  920    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0889  ATPase AAA-2 domain protein  48.77 
 
 
725 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000179007  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0640  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  49.84 
 
 
726 aa  611  1e-173  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.680329  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0571  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  48.11 
 
 
684 aa  605  9.999999999999999e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  47.55 
 
 
810 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1763  ATPase AAA-2 domain protein  47.99 
 
 
712 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1327  ATPase  47.58 
 
 
734 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00363395  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0488  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  49.43 
 
 
753 aa  600  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00725796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  46.57 
 
 
818 aa  598  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  48.48 
 
 
722 aa  595  1e-169  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0578  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  44.84 
 
 
748 aa  593  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  46.48 
 
 
818 aa  591  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  46.55 
 
 
817 aa  590  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  46.48 
 
 
818 aa  591  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0648  ATP-dependent Clp protease  48.13 
 
 
752 aa  585  1e-166  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  47.94 
 
 
823 aa  587  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0684  ATPase AAA-2 domain protein  46.26 
 
 
841 aa  586  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0804  ATPase AAA-2 domain protein  47.18 
 
 
676 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  45.31 
 
 
819 aa  582  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2062  ATPase AAA-2 domain protein  45.8 
 
 
847 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.587119  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3203  ATPase AAA-2 domain protein  45.34 
 
 
853 aa  578  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  46.89 
 
 
829 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  46.76 
 
 
812 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  45.47 
 
 
810 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  44.01 
 
 
812 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  45.15 
 
 
811 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3818  ATPase  45.51 
 
 
857 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  45.23 
 
 
824 aa  571  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  44.61 
 
 
825 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  42.42 
 
 
814 aa  566  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  46.6 
 
 
814 aa  567  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  44.21 
 
 
810 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  45.71 
 
 
829 aa  568  1e-160  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  45.14 
 
 
812 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  46.72 
 
 
835 aa  565  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  46.49 
 
 
840 aa  565  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  46.99 
 
 
816 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1809  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  47.18 
 
 
705 aa  562  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000172721  hitchhiker  0.000000000383819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  44.27 
 
 
812 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11320  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  45.91 
 
 
846 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.952833  normal  0.628396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  45.81 
 
 
854 aa  565  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1369  ATPase AAA-2 domain protein  44.11 
 
 
830 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2116  ATPase AAA-2 domain protein  46.17 
 
 
781 aa  559  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284503  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  46.88 
 
 
860 aa  559  1e-158  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19480  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  44.8 
 
 
865 aa  560  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000156144 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  45.51 
 
 
822 aa  561  1e-158  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  47.23 
 
 
886 aa  558  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  46.08 
 
 
834 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.47 
 
 
828 aa  560  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  45.94 
 
 
841 aa  561  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  46.4 
 
 
839 aa  561  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  44.85 
 
 
812 aa  555  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2156  ATPase  44.14 
 
 
848 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  44.76 
 
 
866 aa  558  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_56  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  44.26 
 
 
824 aa  557  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  45.17 
 
 
824 aa  558  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  46.46 
 
 
812 aa  556  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  45.92 
 
 
837 aa  557  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  43.61 
 
 
825 aa  557  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  45.44 
 
 
846 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0312  ATPase AAA-2  47.48 
 
 
803 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  44.02 
 
 
824 aa  553  1e-156  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  45.89 
 
 
792 aa  552  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0024  ATPase  47.93 
 
 
818 aa  553  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000951044  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  46.94 
 
 
792 aa  553  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  43.71 
 
 
846 aa  554  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0051  ATPase  43.95 
 
 
824 aa  554  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00486444  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1220  ATPase  45.66 
 
 
812 aa  553  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  44.19 
 
 
821 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  46.08 
 
 
850 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  44.91 
 
 
830 aa  552  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1392  ATPase  43.05 
 
 
791 aa  549  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13220  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  44.91 
 
 
862 aa  551  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  42.96 
 
 
855 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  44.81 
 
 
823 aa  550  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  44.88 
 
 
852 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  44.21 
 
 
811 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  46.98 
 
 
869 aa  551  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  42.9 
 
 
791 aa  550  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  45.31 
 
 
834 aa  548  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  42.88 
 
 
879 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2966  ATPase AAA-2 domain protein  44.39 
 
 
842 aa  551  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00321823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  44.77 
 
 
824 aa  549  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2308  ATPase  41.9 
 
 
848 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  45.88 
 
 
814 aa  551  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  45.72 
 
 
814 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  45.76 
 
 
848 aa  551  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  44.4 
 
 
862 aa  551  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  46.15 
 
 
847 aa  549  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3836  ATPase AAA-2 domain-containing protein  45.89 
 
 
825 aa  551  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493394  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  43.11 
 
 
855 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  44.41 
 
 
815 aa  549  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  43.31 
 
 
843 aa  545  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  45.12 
 
 
836 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>