More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1303 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1303  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  100 
 
 
702 aa  1421    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0310613  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2571  ATPase  63.4 
 
 
701 aa  916    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0045  ATPase  70.5 
 
 
745 aa  1009    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0572  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  70.76 
 
 
720 aa  1023    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.544147  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0150  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  73.42 
 
 
716 aa  1043    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1578  ATP-dependent proteinase ATP-binding subunit  77.57 
 
 
699 aa  1107    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2624  ATPase  63.4 
 
 
701 aa  916    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1327  ATPase  50.39 
 
 
734 aa  617  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00363395  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0640  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  46.28 
 
 
726 aa  615  9.999999999999999e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.680329  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0571  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  47.14 
 
 
684 aa  613  9.999999999999999e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0578  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  47.35 
 
 
748 aa  610  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  50 
 
 
722 aa  605  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0889  ATPase AAA-2 domain protein  50.4 
 
 
725 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000179007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0648  ATP-dependent Clp protease  50 
 
 
752 aa  597  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1763  ATPase AAA-2 domain protein  50.24 
 
 
712 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0488  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  46.77 
 
 
753 aa  585  1.0000000000000001e-165  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00725796  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  45.71 
 
 
819 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  45.51 
 
 
817 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  45.29 
 
 
818 aa  574  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  45.29 
 
 
818 aa  574  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  45.3 
 
 
811 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  46.28 
 
 
812 aa  568  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  45 
 
 
810 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  47.41 
 
 
812 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0684  ATPase AAA-2 domain protein  46.96 
 
 
841 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  47.87 
 
 
837 aa  560  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  45.37 
 
 
810 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0312  ATPase AAA-2  48.7 
 
 
803 aa  559  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  46.17 
 
 
814 aa  556  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  44.88 
 
 
823 aa  558  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  45.76 
 
 
854 aa  558  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  45.8 
 
 
825 aa  556  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  44.14 
 
 
818 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  44.55 
 
 
810 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1494  ATPase  46.34 
 
 
830 aa  553  1e-156  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000400156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  47.62 
 
 
823 aa  554  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  45.34 
 
 
848 aa  552  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1809  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  44.4 
 
 
705 aa  555  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000172721  hitchhiker  0.000000000383819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3818  ATPase  47.86 
 
 
857 aa  552  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2116  ATPase AAA-2 domain protein  47.58 
 
 
781 aa  554  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  45.13 
 
 
826 aa  552  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  45.83 
 
 
855 aa  553  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  45.14 
 
 
824 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  46.13 
 
 
814 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  46.37 
 
 
812 aa  550  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  45.73 
 
 
868 aa  551  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  45.54 
 
 
830 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  45.63 
 
 
847 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  46.08 
 
 
825 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  44.78 
 
 
852 aa  551  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  45.05 
 
 
812 aa  550  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  44.67 
 
 
862 aa  546  1e-154  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1369  ATPase AAA-2 domain protein  44.65 
 
 
830 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  44.14 
 
 
841 aa  545  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  46.08 
 
 
821 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  45.24 
 
 
850 aa  547  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  43.48 
 
 
837 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.66 
 
 
828 aa  546  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_56  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  45.07 
 
 
824 aa  548  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  44.92 
 
 
851 aa  547  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  44.07 
 
 
834 aa  548  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  44.68 
 
 
869 aa  546  1e-154  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  45.47 
 
 
847 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  45.23 
 
 
851 aa  543  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  43.62 
 
 
812 aa  542  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0051  ATPase  44.46 
 
 
824 aa  543  1e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00486444  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  44.33 
 
 
852 aa  542  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  47.39 
 
 
824 aa  543  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  43.7 
 
 
846 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  46.43 
 
 
826 aa  543  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  46.19 
 
 
825 aa  544  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2062  ATPase AAA-2 domain protein  44.61 
 
 
847 aa  544  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.587119  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  44.51 
 
 
866 aa  543  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  45.19 
 
 
829 aa  545  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  44.31 
 
 
824 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  42.94 
 
 
812 aa  541  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1220  ATPase  43.42 
 
 
812 aa  542  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  43.59 
 
 
835 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  46.19 
 
 
824 aa  540  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  44.58 
 
 
834 aa  538  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  45.92 
 
 
848 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  44 
 
 
834 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  45.61 
 
 
844 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  45.3 
 
 
844 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  45.3 
 
 
836 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  43.45 
 
 
839 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  43.5 
 
 
815 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  44.83 
 
 
811 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  44.83 
 
 
811 aa  536  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  44.83 
 
 
811 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  45.31 
 
 
847 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  44.68 
 
 
811 aa  537  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  43.77 
 
 
822 aa  538  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  44.83 
 
 
830 aa  535  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  44.29 
 
 
829 aa  537  1e-151  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  45.47 
 
 
847 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  44.68 
 
 
842 aa  538  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  44.56 
 
 
811 aa  538  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  45.47 
 
 
847 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5411  ATPase  45.76 
 
 
953 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0379558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>