85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1030 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1030  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  471  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1519  hypothetical protein  87.83 
 
 
232 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1548  hypothetical protein  87.83 
 
 
232 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0213988  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1584  putative neutral zinc metallopeptidase  55.46 
 
 
226 aa  218  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1252  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  55.02 
 
 
227 aa  217  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0460756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1411  hypothetical protein  54.59 
 
 
227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0315279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1438  hypothetical protein  55.91 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000185064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1551  hypothetical protein  55.91 
 
 
226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00641038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1656  neutral zinc metallopeptidase, putative  54.59 
 
 
226 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3761  putative neutral zinc metallopeptidase  53.71 
 
 
226 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1410  hypothetical protein  54.15 
 
 
227 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000926108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1454  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  53.71 
 
 
226 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.231927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1995  putative neutral zinc metallopeptidase  49.32 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1713  neutral zinc metallopeptidase superfamily protein  49.32 
 
 
231 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.518454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1336  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  47.51 
 
 
229 aa  194  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0322886  normal  0.654146 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1405  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.15 
 
 
230 aa  191  7e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.456172  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1207  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  49.52 
 
 
226 aa  190  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1531  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.78 
 
 
232 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1041  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  47.03 
 
 
231 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2163  hypothetical protein  46.92 
 
 
226 aa  186  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0187619  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1382  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  42.41 
 
 
232 aa  185  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486088  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1520  Zn-dependent protease  41.07 
 
 
232 aa  185  6e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000439151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1281  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  44.8 
 
 
230 aa  184  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000274008  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1638  hypothetical protein  41.07 
 
 
232 aa  184  9e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000160464  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1515  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  44.34 
 
 
230 aa  182  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.394934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2490  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  49.52 
 
 
241 aa  182  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1700  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  44.55 
 
 
227 aa  181  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.444162  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1381  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  45.95 
 
 
230 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0570  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  47.37 
 
 
227 aa  177  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000147149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0520  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  45.45 
 
 
228 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.282294  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1205  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  45.37 
 
 
223 aa  175  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1508  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  45.73 
 
 
231 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.703268  normal  0.326694 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0094  Zn-dependent protease  41.36 
 
 
235 aa  175  7e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198706 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09910  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  50.51 
 
 
230 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4291  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.12 
 
 
226 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.268812  normal  0.9686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4229  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.12 
 
 
226 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1753  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  40.97 
 
 
227 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1054  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.84 
 
 
236 aa  169  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3467  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  44.81 
 
 
226 aa  168  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1608  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  44.14 
 
 
230 aa  167  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04520  hypothetical protein  41.28 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.771787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4552  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.92 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1804  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.61 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000840168  normal  0.357592 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1695  putative neutral zinc metallopeptidase  52.88 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0715464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0879  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  43.53 
 
 
229 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0863  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.71 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.365569  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1168  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  45.19 
 
 
230 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1622  putative neutral zinc metallopeptidase  52.88 
 
 
185 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.201247 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1356  hypothetical protein  40 
 
 
223 aa  160  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1159  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  43.72 
 
 
230 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0359045  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1667  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.99 
 
 
231 aa  159  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000053679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1229  hypothetical protein  44.1 
 
 
224 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0200777  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0894  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  43.11 
 
 
252 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0336  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.27 
 
 
235 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.025885  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1438  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  44.44 
 
 
229 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0922  hypothetical protein  41.58 
 
 
230 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4105  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  39.83 
 
 
236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1282  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  40.69 
 
 
226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3740  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  42.71 
 
 
230 aa  151  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1307  hypothetical protein  41.21 
 
 
233 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.251221  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0016  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.47 
 
 
230 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3489  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.51 
 
 
234 aa  148  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0123  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.06 
 
 
238 aa  145  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0434919  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3831  hypothetical protein  39.91 
 
 
232 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1771  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.18 
 
 
229 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1387  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.41 
 
 
235 aa  141  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0558  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  40.91 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.141328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1733  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  37.78 
 
 
223 aa  137  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  hitchhiker  0.00797114 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06240  predicted Zn-dependent protease  36.57 
 
 
221 aa  134  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000728201  hitchhiker  0.0055368 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0900  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  37.5 
 
 
228 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12170  predicted Zn-dependent protease  35.53 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2319  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  36.36 
 
 
227 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0858  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  37.5 
 
 
214 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.401397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1818  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  36.32 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0708961  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3069  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  36.87 
 
 
226 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1976  hypothetical protein  34.22 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0175  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  34.45 
 
 
230 aa  112  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0640  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  36.96 
 
 
228 aa  111  9e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.575785  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1687  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  32.33 
 
 
226 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.780975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4839  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  33.33 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4363  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  32.86 
 
 
228 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1749  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  30.81 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4083  hypothetical protein  31.6 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000143181  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3871  hypothetical protein  28.44 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.210798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  27.21 
 
 
711 aa  41.6  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>