84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0863 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0863  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  100 
 
 		 230 aa  467  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.365569  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1608  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  90 
 
 		 230 aa  409  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1307  hypothetical protein  85.09 
 
 		 233 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.251221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0922  hypothetical protein  78.7 
 
 		 230 aa  362  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1159  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  83.48 
 
 		 230 aa  359  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0359045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1168  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  81.14 
 
 		 230 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1520  Zn-dependent protease  52.61 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000439151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1382  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  53.04 
 
 		 232 aa  234  6e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486088  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1638  hypothetical protein  52.91 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000160464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1995  putative neutral zinc metallopeptidase  50.22 
 
 		 231 aa  224  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1713  neutral zinc metallopeptidase superfamily protein  50.22 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.518454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1041  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  48.91 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0336  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  48.23 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.025885  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2163  hypothetical protein  50.88 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0187619  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1405  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  47.53 
 
 		 230 aa  208  7e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.456172  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1387  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  53.22 
 
 		 235 aa  207  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1336  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  45.61 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0322886  normal  0.654146 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1281  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  48.39 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000274008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1531  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.15 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1508  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  48.05 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.703268  normal  0.326694 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1700  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  50.73 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.444162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4291  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  49.78 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.268812  normal  0.9686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4229  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  49.78 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4105  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.19 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1381  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  43.91 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1667  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  49.31 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000053679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0520  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  44.78 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.282294  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1207  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.83 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375115  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1515  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  43.95 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.394934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09910  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  51.32 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1229  hypothetical protein  50.23 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0200777  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0094  Zn-dependent protease  42.79 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198706 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1030  hypothetical protein  43.06 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1804  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.15 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000840168  normal  0.357592 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1753  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  44.98 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1054  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  47.35 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2490  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.48 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1205  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  51.18 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0570  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  45.22 
 
 		 227 aa  174  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000147149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3740  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  45.85 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1584  putative neutral zinc metallopeptidase  47.96 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1252  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.43 
 
 		 227 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0460756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1411  hypothetical protein  47.26 
 
 		 227 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0315279  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1438  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  45.45 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1548  hypothetical protein  42.79 
 
 		 232 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0213988  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1519  hypothetical protein  42.79 
 
 		 232 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1438  hypothetical protein  46.73 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000185064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1771  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  47.2 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1551  hypothetical protein  46.94 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00641038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1282  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  44.33 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3761  putative neutral zinc metallopeptidase  44.9 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04520  hypothetical protein  41.47 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.771787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1454  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  44.39 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.231927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1410  hypothetical protein  44.9 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000926108  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1356  hypothetical protein  41.36 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3489  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  44.08 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2319  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  44.64 
 
 		 227 aa  161  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1656  neutral zinc metallopeptidase, putative  44.39 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0858  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  47.52 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.401397  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0558  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  41.96 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.141328  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0123  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.43 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0434919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3467  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  40.95 
 
 		 226 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06240  predicted Zn-dependent protease  40.44 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000728201  hitchhiker  0.0055368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0016  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  39.65 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12170  predicted Zn-dependent protease  43.52 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1733  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  40.44 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  hitchhiker  0.00797114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0879  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  40.91 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4552  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  39.46 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1695  putative neutral zinc metallopeptidase  49.2 
 
 		 185 aa  138  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0715464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1622  putative neutral zinc metallopeptidase  49.68 
 
 		 185 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.201247 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0894  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  38.33 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3831  hypothetical protein  38.29 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3069  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  38.65 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0640  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  40.48 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.575785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0900  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  36.02 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0175  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  36.87 
 
 		 230 aa  114  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1976  hypothetical protein  33.62 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1818  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  37.1 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0708961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4363  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  34.95 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4839  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  34.95 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1749  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  32.7 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1687  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  33.33 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.780975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4083  hypothetical protein  30.19 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000143181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3871  hypothetical protein  28.3 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.210798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>