84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0879 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0879  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  100 
 
 
229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0558  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  58.59 
 
 
227 aa  266  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.141328  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3467  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  58.48 
 
 
226 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4552  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  55.61 
 
 
226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0016  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  57.14 
 
 
230 aa  249  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04520  hypothetical protein  58.14 
 
 
217 aa  246  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.771787  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0894  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  58.06 
 
 
252 aa  234  8e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1356  hypothetical protein  49.78 
 
 
223 aa  224  7e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3831  hypothetical protein  53.02 
 
 
232 aa  224  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1030  hypothetical protein  43.53 
 
 
231 aa  177  9e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1584  putative neutral zinc metallopeptidase  46.05 
 
 
226 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1041  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  45.16 
 
 
231 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1252  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  45.18 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0460756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1438  hypothetical protein  44.54 
 
 
271 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000185064  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1515  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  45.15 
 
 
230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.394934  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1551  hypothetical protein  44.54 
 
 
226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00641038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1411  hypothetical protein  43.67 
 
 
227 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0315279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1531  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.33 
 
 
232 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0520  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.27 
 
 
228 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.282294  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1713  neutral zinc metallopeptidase superfamily protein  43.32 
 
 
231 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.518454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1995  putative neutral zinc metallopeptidase  43.32 
 
 
231 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1519  hypothetical protein  41.48 
 
 
232 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1548  hypothetical protein  41.48 
 
 
232 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0213988  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1382  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  41.47 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486088  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1405  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42 
 
 
230 aa  165  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.456172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1700  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.48 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.444162  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3761  putative neutral zinc metallopeptidase  43.4 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1281  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  40 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000274008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1656  neutral zinc metallopeptidase, putative  42.8 
 
 
226 aa  161  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1454  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  43.64 
 
 
226 aa  161  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.231927  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1520  Zn-dependent protease  41.01 
 
 
232 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000439151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1410  hypothetical protein  42.37 
 
 
227 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000926108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2490  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  43.69 
 
 
241 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1229  hypothetical protein  43.89 
 
 
224 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0200777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1336  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  38.99 
 
 
229 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0322886  normal  0.654146 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1381  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  40.28 
 
 
230 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2163  hypothetical protein  42.38 
 
 
226 aa  159  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0187619  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1638  hypothetical protein  40.09 
 
 
232 aa  157  9e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000160464  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1307  hypothetical protein  44.09 
 
 
233 aa  157  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.251221  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1207  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.38 
 
 
226 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375115  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0094  Zn-dependent protease  40.36 
 
 
235 aa  155  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198706 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0922  hypothetical protein  41.55 
 
 
230 aa  154  8e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1804  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  40.53 
 
 
224 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000840168  normal  0.357592 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1733  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  38.43 
 
 
223 aa  153  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  hitchhiker  0.00797114 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1608  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.36 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3489  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  37.67 
 
 
234 aa  151  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09910  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.55 
 
 
230 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4291  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.58 
 
 
226 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.268812  normal  0.9686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4229  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.58 
 
 
226 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0863  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  40.91 
 
 
230 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.365569  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0123  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.03 
 
 
238 aa  149  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0434919  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1205  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  46.15 
 
 
223 aa  148  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1054  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.9 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1753  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  41.06 
 
 
227 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1508  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  38.86 
 
 
231 aa  144  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.703268  normal  0.326694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0570  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  39.53 
 
 
227 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000147149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1622  putative neutral zinc metallopeptidase  44.97 
 
 
185 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.201247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1695  putative neutral zinc metallopeptidase  43.92 
 
 
185 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0715464  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1168  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  40.89 
 
 
230 aa  141  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1282  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  41.85 
 
 
226 aa  141  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4105  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  37.45 
 
 
236 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1771  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.41 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1159  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  40.45 
 
 
230 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0359045  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12170  predicted Zn-dependent protease  38.94 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1438  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  39.23 
 
 
229 aa  135  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2319  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  38.71 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0858  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  40.4 
 
 
214 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.401397  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06240  predicted Zn-dependent protease  40.38 
 
 
221 aa  131  6.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000728201  hitchhiker  0.0055368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3740  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  37.99 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1667  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  38.43 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000053679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0336  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  33.05 
 
 
235 aa  125  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.025885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0900  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  37.25 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0640  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  39.7 
 
 
228 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.575785  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1387  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  36.09 
 
 
235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3069  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  35.85 
 
 
226 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1749  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  34.22 
 
 
229 aa  101  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1818  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  31.65 
 
 
229 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0708961  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4363  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  33.66 
 
 
228 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4839  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  33.66 
 
 
228 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1976  hypothetical protein  33.16 
 
 
228 aa  96.7  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0175  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  34.98 
 
 
230 aa  95.5  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1687  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  34.47 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.780975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4083  hypothetical protein  30.73 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000143181  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3871  hypothetical protein  29.58 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.210798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>