85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0858 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0858  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  100 
 
 
214 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.401397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2319  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  98.13 
 
 
227 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1381  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  51.16 
 
 
230 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4291  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  50.78 
 
 
226 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.268812  normal  0.9686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4229  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  50.78 
 
 
226 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1700  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  51.71 
 
 
227 aa  187  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.444162  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1515  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  43.33 
 
 
230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.394934  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1207  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  45.59 
 
 
226 aa  181  9.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0520  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  47.66 
 
 
228 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.282294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1531  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  44.88 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1804  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  47.8 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000840168  normal  0.357592 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1995  putative neutral zinc metallopeptidase  43.19 
 
 
231 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1713  neutral zinc metallopeptidase superfamily protein  42.72 
 
 
231 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.518454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1336  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  44.22 
 
 
229 aa  168  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0322886  normal  0.654146 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2163  hypothetical protein  40.2 
 
 
226 aa  167  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0187619  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1411  hypothetical protein  48.28 
 
 
227 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0315279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1584  putative neutral zinc metallopeptidase  47.7 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0094  Zn-dependent protease  43.6 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198706 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09910  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  48.68 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1041  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  47.6 
 
 
231 aa  165  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1438  hypothetical protein  47.7 
 
 
271 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000185064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1252  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  48.28 
 
 
227 aa  164  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0460756  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2490  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  44.22 
 
 
241 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1551  hypothetical protein  47.7 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00641038  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0922  hypothetical protein  48.53 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1168  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  47.52 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1771  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  50.5 
 
 
229 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0863  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  47.52 
 
 
230 aa  160  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.365569  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1281  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  42.72 
 
 
230 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000274008  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1608  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  47.52 
 
 
230 aa  158  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1410  hypothetical protein  47.7 
 
 
227 aa  158  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000926108  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1405  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.72 
 
 
230 aa  158  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.456172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1454  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  48.28 
 
 
226 aa  158  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.231927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1656  neutral zinc metallopeptidase, putative  47.7 
 
 
226 aa  158  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3761  putative neutral zinc metallopeptidase  47.7 
 
 
226 aa  157  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1307  hypothetical protein  47.52 
 
 
233 aa  153  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.251221  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1667  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  45.77 
 
 
231 aa  154  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000053679  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1282  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  44.34 
 
 
226 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1438  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  43.32 
 
 
229 aa  150  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0570  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  42.79 
 
 
227 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000147149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1229  hypothetical protein  47.87 
 
 
224 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0200777  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1159  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  48.8 
 
 
230 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0359045  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1753  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  43.44 
 
 
227 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1520  Zn-dependent protease  41.63 
 
 
232 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000439151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1508  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  45.29 
 
 
231 aa  148  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.703268  normal  0.326694 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12170  predicted Zn-dependent protease  41.74 
 
 
224 aa  148  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0123  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  38.5 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0434919  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1054  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  43.48 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019978  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1382  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  40.67 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486088  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1638  hypothetical protein  40.67 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000160464  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1733  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.35 
 
 
223 aa  145  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  hitchhiker  0.00797114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1387  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  42.4 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3740  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  44.84 
 
 
230 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1519  hypothetical protein  43.2 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1548  hypothetical protein  43.2 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0213988  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1695  putative neutral zinc metallopeptidase  46.41 
 
 
185 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0715464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3467  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  43.64 
 
 
226 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1622  putative neutral zinc metallopeptidase  45.75 
 
 
185 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.201247 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0640  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  39.13 
 
 
228 aa  136  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.575785  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1205  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  43 
 
 
223 aa  135  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4105  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  40.19 
 
 
236 aa  135  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1030  hypothetical protein  36.89 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06240  predicted Zn-dependent protease  37.32 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000728201  hitchhiker  0.0055368 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1356  hypothetical protein  37.93 
 
 
223 aa  132  5e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0558  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  37.56 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.141328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3489  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  38.74 
 
 
234 aa  128  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0336  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  35.35 
 
 
235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.025885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0879  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  40.4 
 
 
229 aa  125  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04520  hypothetical protein  34.5 
 
 
217 aa  124  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.771787  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0900  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  40 
 
 
228 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0894  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  39.09 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1818  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  42.29 
 
 
229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0708961  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3069  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  41.58 
 
 
226 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4552  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  36.24 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4839  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41.5 
 
 
228 aa  115  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4363  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  41 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0016  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  35.51 
 
 
230 aa  112  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3831  hypothetical protein  35.78 
 
 
232 aa  111  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0175  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  37.44 
 
 
230 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1749  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  36.98 
 
 
229 aa  105  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1687  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  35.81 
 
 
226 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.780975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1976  hypothetical protein  30.4 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4083  hypothetical protein  35.15 
 
 
225 aa  82  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000143181  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3871  hypothetical protein  31.84 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.210798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2164  hypothetical protein  34.69 
 
 
420 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0846232  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>