84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3871 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3871  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  460  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.210798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4083  hypothetical protein  48.21 
 
 		 225 aa  221  9e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000143181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1818  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  42.53 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0708961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0900  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  40.28 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4363  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  37.17 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3069  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  40.76 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1976  hypothetical protein  36.56 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0175  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  38.6 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4839  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  35.81 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1749  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  35.21 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1687  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  36.56 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.780975  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1733  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  31.88 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  hitchhiker  0.00797114 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1405  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  31.94 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.456172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0520  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  30.45 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.282294  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1281  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  33 
 
 		 230 aa  89  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000274008  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1515  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  30.14 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.394934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09910  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  30.41 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06240  predicted Zn-dependent protease  29.38 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000728201  hitchhiker  0.0055368 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0094  Zn-dependent protease  32.69 
 
 		 235 aa  85.1  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1381  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  30.99 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12170  predicted Zn-dependent protease  30.19 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4105  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  30.59 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2163  hypothetical protein  31.9 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0187619  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1207  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  31.68 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1336  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  32.45 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0322886  normal  0.654146 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1531  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  30.56 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1700  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  29.96 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.444162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1041  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  33.33 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1054  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  28.8 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019978  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1804  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  31.98 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000840168  normal  0.357592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4229  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  31.86 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4291  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  31.86 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.268812  normal  0.9686 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1667  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  29.95 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000053679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1771  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  33.33 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1995  putative neutral zinc metallopeptidase  27.96 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1713  neutral zinc metallopeptidase superfamily protein  27.96 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.518454  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1382  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  29.21 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486088  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0336  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  28.36 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.025885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0570  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  32.28 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000147149  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0894  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  32.24 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1520  Zn-dependent protease  29 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000439151  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1753  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  31.96 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1252  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  29.79 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0460756  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1638  hypothetical protein  29 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000160464  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1030  hypothetical protein  28.44 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1551  hypothetical protein  30.32 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00641038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4552  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  30.45 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1584  putative neutral zinc metallopeptidase  29.79 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1548  hypothetical protein  29.74 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0213988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1438  hypothetical protein  30.32 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000185064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1519  hypothetical protein  29.74 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1411  hypothetical protein  29.26 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0315279  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1356  hypothetical protein  29.38 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04520  hypothetical protein  30.16 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.771787  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1282  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  30.9 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0558  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  28.7 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1438  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  33.92 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0123  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  26.67 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0434919  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1508  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  32.95 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.703268  normal  0.326694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0858  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  31.11 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.401397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2319  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  31.11 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3761  putative neutral zinc metallopeptidase  29.79 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1656  neutral zinc metallopeptidase, putative  30.32 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1410  hypothetical protein  30.32 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000926108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3831  hypothetical protein  32.07 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1454  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  30.32 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.231927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1229  hypothetical protein  29.96 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0200777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1307  hypothetical protein  29.29 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.251221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2490  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  30.52 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1622  putative neutral zinc metallopeptidase  30.43 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.201247 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1205  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  29.88 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0016  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  29.58 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3489  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  32.3 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0879  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  28.85 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1695  putative neutral zinc metallopeptidase  28.99 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0715464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3467  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  28.7 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0922  hypothetical protein  26.26 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1168  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  29.95 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1608  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  27.78 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3740  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  32.39 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0863  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  26.18 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.365569  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1159  peptidase, membrane zinc metallopeptidase, putative  27.91 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0359045  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0640  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  22.89 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.575785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2164  hypothetical protein  28.16 
 
 		 420 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0846232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>