More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0746 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0746  penicillin-binding protein 1  100 
 
 
775 aa  1583    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1240  penicillin-binding protein 1  81.86 
 
 
744 aa  1199    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.575725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1265  penicillin-binding protein 1  81.86 
 
 
744 aa  1199    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.44 
 
 
737 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1207  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.6 
 
 
716 aa  491  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.222588  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.34 
 
 
736 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2679  penicillin-binding protein  36.92 
 
 
712 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2717  penicillin-binding protein  36.66 
 
 
712 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3962  penicillin-binding protein  37.94 
 
 
716 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2431  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  36.75 
 
 
712 aa  445  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00172457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2392  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  36.75 
 
 
712 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2666  penicillin-binding protein  36.75 
 
 
712 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2634  penicillin-binding protein  36.52 
 
 
712 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000396671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2467  penicillin-binding protein  36.75 
 
 
712 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00794581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3767  penicillin-binding protein  37.79 
 
 
716 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3675  penicillin-binding protein  37.65 
 
 
716 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3969  penicillin-binding protein  38.08 
 
 
699 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00715296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2648  penicillin-binding protein  36.75 
 
 
712 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4055  penicillin-binding protein  37.79 
 
 
716 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3743  peptidoglycan glycosyltransferase  38.08 
 
 
699 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2677  penicillin-binding protein  36.52 
 
 
712 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3658  penicillin-binding protein  37.65 
 
 
716 aa  438  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3931  penicillin-binding protein  37.5 
 
 
699 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0456911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4017  penicillin-binding protein  37.26 
 
 
716 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1224  penicillin-binding protein  37.12 
 
 
699 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0433521  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  37.35 
 
 
717 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2488  peptidoglycan glycosyltransferase  34.68 
 
 
712 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00738321  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0587  peptidoglycan glycosyltransferase  37.18 
 
 
719 aa  418  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1498  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.04 
 
 
708 aa  403  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1149  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.79 
 
 
712 aa  389  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.149842  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0937  penicillin-binding protein  31.4 
 
 
765 aa  314  2.9999999999999996e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.653489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1666  penicillin binding protein 2X  31.05 
 
 
755 aa  301  2e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0287  penicillin-binding protein 2X  32.94 
 
 
752 aa  300  6e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  32.22 
 
 
708 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.44 
 
 
704 aa  276  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 
649 aa  266  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  29.18 
 
 
740 aa  260  7e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.67 
 
 
730 aa  260  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  31.31 
 
 
638 aa  259  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  30.93 
 
 
638 aa  259  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  30.7 
 
 
638 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  30.87 
 
 
638 aa  258  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  31.17 
 
 
638 aa  258  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  30.87 
 
 
638 aa  257  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  30.83 
 
 
638 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  30.83 
 
 
638 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  30.83 
 
 
638 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.19 
 
 
582 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  30.83 
 
 
638 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  30.21 
 
 
646 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  30.83 
 
 
638 aa  252  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  28.82 
 
 
695 aa  251  5e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  30.73 
 
 
644 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  29.63 
 
 
708 aa  248  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  31.37 
 
 
645 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  28.74 
 
 
723 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  29.82 
 
 
682 aa  241  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  28.49 
 
 
713 aa  240  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.89 
 
 
662 aa  240  9e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  27.96 
 
 
719 aa  238  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  31.51 
 
 
553 aa  238  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  28.93 
 
 
711 aa  236  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  28.49 
 
 
705 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  28.09 
 
 
657 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  28.02 
 
 
727 aa  226  9e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  26.91 
 
 
721 aa  225  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  26.98 
 
 
728 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.41 
 
 
657 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  28.44 
 
 
734 aa  223  9e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2117  stage V sporulation protein D  27.63 
 
 
739 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.99 
 
 
672 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  27.75 
 
 
727 aa  220  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  26.66 
 
 
739 aa  219  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  27.65 
 
 
657 aa  217  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  27.84 
 
 
660 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.93 
 
 
553 aa  213  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.21 
 
 
654 aa  211  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  28.11 
 
 
586 aa  210  9e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  27.47 
 
 
690 aa  203  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  28.07 
 
 
671 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  26.85 
 
 
656 aa  202  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.2 
 
 
645 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  29.24 
 
 
729 aa  195  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  27.3 
 
 
631 aa  195  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.95 
 
 
588 aa  194  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  25.11 
 
 
649 aa  193  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.27 
 
 
570 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.54 
 
 
654 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  26.6 
 
 
675 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.45 
 
 
571 aa  191  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2846  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.49 
 
 
602 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  27 
 
 
657 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  28.41 
 
 
638 aa  189  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.75 
 
 
644 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  27.45 
 
 
673 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3780  peptidoglycan glycosyltransferase  29.61 
 
 
618 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106243 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.22 
 
 
675 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.07 
 
 
675 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.02 
 
 
582 aa  185  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1101  peptidoglycan glycosyltransferase  28.52 
 
 
618 aa  185  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0114391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>