14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0456 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0456  rhomboid family protein  100 
 
 		 228 aa  443  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0467  rhomboid family protein  89.47 
 
 		 228 aa  362  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0830945 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2835  hypothetical protein  52.49 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00353062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0444  rhomboid-like protein  50.22 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0895  rhomboid-like protein  50 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3954  rhomboid family protein  47.26 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0843422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3232  protein tyrosine phosphatase  30.65 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3327  rhomboid family membrane protein  30.81 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0229306  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4052  rhomboid family protein  30.3 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0629739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  32.14 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4233  rhomboid-like protein  22.5 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386042  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  33.06 
 
 		 625 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  33.06 
 
 		 625 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.06 
 
 		 625 aa  42  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>