17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0895 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0895  rhomboid-like protein  100 
 
 		 227 aa  443  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2835  hypothetical protein  54.19 
 
 		 227 aa  251  9.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00353062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0444  rhomboid-like protein  47.79 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0456  rhomboid family protein  50 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0467  rhomboid family protein  49.56 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0830945 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3954  rhomboid family protein  38.56 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0843422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3232  protein tyrosine phosphatase  26.24 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  26.09 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4233  rhomboid-like protein  29.41 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2361  rhomboid family protein  30.12 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  24.64 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  24.64 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  25.36 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  25.56 
 
 		 519 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  24.64 
 
 		 190 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  24.29 
 
 		 182 aa  42  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  24.64 
 
 		 190 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>