55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1424 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1424  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  100 
 
 		 172 aa  349  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4502  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  55.29 
 
 		 171 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.145452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0068  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  43.36 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0965  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  47.01 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.12665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3190  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.41 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.559222 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1884  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  38.52 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1196  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  33.33 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.233387  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03721  NADH dehydrogenase subunit J  26.92 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.238222 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1658  NADH dehydrogenase subunit J  26.28 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.677545  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03161  NADH dehydrogenase subunit J  29.91 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  28.83 
 
 		 200 aa  47.8  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1595  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.17 
 
 		 201 aa  47.8  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  30.91 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03151  NADH dehydrogenase subunit J  30.36 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0737318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3633  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  26.06 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5971  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.5 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0294  NADH dehydrogenase subunit J  29.31 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0205  NADH dehydrogenase subunit J  28.07 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00876666  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0232  NADH dehydrogenase subunit J  31.25 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03360  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, putative  26.26 
 
 		 284 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0844  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.38 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0547  NADH-quinone oxidoreductase chain C  24.51 
 
 		 227 aa  44.7  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03251  NADH dehydrogenase subunit J  26.79 
 
 		 176 aa  44.7  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1616  NADH dehydrogenase (ubiquinone), C subunit  24.51 
 
 		 227 aa  44.7  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0142327  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  33.71 
 
 		 554 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  26.47 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1827  NADH dehydrogenase subunit C  30.77 
 
 		 268 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.181589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0665  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  31.07 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  26.47 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3621  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  29.69 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  24.26 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0963  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.38 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0424624  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  24.51 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  25 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  25.49 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  26.17 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  26.47 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3298  NADH dehydrogenase subunit C  27.33 
 
 		 204 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0911  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  26.98 
 
 		 213 aa  42.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3253  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  40.48 
 
 		 560 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  29.49 
 
 		 214 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  24.39 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1295  NADH dehydrogenase subunit C  29.89 
 
 		 158 aa  42  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0846  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  31.25 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2885  NADH dehydrogenase subunit C  26.25 
 
 		 204 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419864  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3254  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  22.82 
 
 		 203 aa  41.2  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.846345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4173  NADH dehydrogenase subunit J  28.44 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2301  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  27.94 
 
 		 309 aa  41.2  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3181  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  45.95 
 
 		 561 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1182  NADH dehydrogenase subunit J  27.52 
 
 		 172 aa  41.2  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  25.23 
 
 		 206 aa  40.8  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0201  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  31.96 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60118 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03181  NADH dehydrogenase subunit J  25.89 
 
 		 180 aa  40.8  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.219066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0484  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  27.06 
 
 		 209 aa  40.8  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  28.21 
 
 		 200 aa  40.8  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>