More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0958 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
326 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.31 
 
 
334 aa  333  3e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.6 
 
 
345 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.6 
 
 
353 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.97 
 
 
339 aa  322  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.6 
 
 
351 aa  322  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.19 
 
 
339 aa  319  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.63 
 
 
332 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.81 
 
 
351 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.69 
 
 
337 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.56 
 
 
322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.65 
 
 
353 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.72 
 
 
337 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.46 
 
 
322 aa  298  7e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.83 
 
 
331 aa  298  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.46 
 
 
331 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.92 
 
 
313 aa  297  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.41 
 
 
398 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.31 
 
 
325 aa  297  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55 
 
 
355 aa  295  8e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.99 
 
 
347 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.99 
 
 
346 aa  294  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.02 
 
 
346 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.83 
 
 
331 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.71 
 
 
322 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.34 
 
 
346 aa  288  7e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.31 
 
 
339 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3178  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.52 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.965716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.77 
 
 
331 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.02 
 
 
399 aa  275  8e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.12 
 
 
341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.3 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.72 
 
 
341 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.68 
 
 
329 aa  268  7e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.77 
 
 
297 aa  268  8.999999999999999e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.43 
 
 
327 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.77 
 
 
329 aa  263  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.06 
 
 
313 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.37 
 
 
331 aa  260  2e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.89 
 
 
362 aa  258  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.06 
 
 
313 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.4 
 
 
341 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_002978  WD0170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.46 
 
 
314 aa  255  6e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.225843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.5 
 
 
312 aa  255  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
333 aa  255  8e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.09 
 
 
314 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.31 
 
 
337 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.23 
 
 
313 aa  253  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0921  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.81 
 
 
296 aa  253  5.000000000000001e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.87 
 
 
301 aa  252  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.55 
 
 
315 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.95 
 
 
321 aa  249  6e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 
330 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.34 
 
 
332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.11 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3812  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.69 
 
 
313 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.23 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.74 
 
 
313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0936286  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0840  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.43 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4416  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.43 
 
 
313 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.62 
 
 
315 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.62 
 
 
315 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.45 
 
 
347 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2732  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.33 
 
 
319 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.3 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.98 
 
 
315 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.55 
 
 
316 aa  238  9e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.88 
 
 
303 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.69 
 
 
304 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.1 
 
 
313 aa  235  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.28 
 
 
312 aa  235  8e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.09 
 
 
313 aa  235  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1997  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.81 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.573092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3506  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.13 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3097  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.05 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0522  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.9 
 
 
313 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0551  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.9 
 
 
313 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3435  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.77 
 
 
311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.022663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3637  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.9 
 
 
313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0480  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.54 
 
 
313 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.64263  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.05 
 
 
313 aa  233  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0455  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.22 
 
 
313 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.86 
 
 
313 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0378  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.57 
 
 
313 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3463  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.52 
 
 
319 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.57 
 
 
313 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.05 
 
 
319 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.69 
 
 
317 aa  231  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3578  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.57 
 
 
313 aa  231  9e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.8 
 
 
307 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.37 
 
 
317 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000297627  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2626  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.71 
 
 
306 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.738919  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0393  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.89 
 
 
313 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.47 
 
 
313 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0419  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.89 
 
 
313 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.89 
 
 
313 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0405  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.89 
 
 
313 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.95 
 
 
314 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4227  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.57 
 
 
313 aa  230  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>