More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4641 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  98.29 
 
 
353 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
351 aa  682    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  91.45 
 
 
351 aa  608  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  75.64 
 
 
353 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  75.9 
 
 
337 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  72.97 
 
 
339 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.17 
 
 
332 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.53 
 
 
345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.67 
 
 
337 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.69 
 
 
398 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.66 
 
 
355 aa  332  5e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.13 
 
 
339 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.26 
 
 
331 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.46 
 
 
346 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.6 
 
 
326 aa  322  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.68 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.29 
 
 
322 aa  320  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.23 
 
 
331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.35 
 
 
331 aa  318  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.94 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.28 
 
 
325 aa  311  6.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.22 
 
 
339 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.29 
 
 
346 aa  306  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.98 
 
 
347 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.73 
 
 
322 aa  305  9.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.38 
 
 
341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.46 
 
 
332 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.68 
 
 
346 aa  301  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.72 
 
 
329 aa  300  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.31 
 
 
334 aa  299  5e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.28 
 
 
330 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.81 
 
 
331 aa  292  5e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.73 
 
 
327 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.1 
 
 
341 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.1 
 
 
333 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.19 
 
 
322 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.96 
 
 
329 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56 
 
 
362 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.95 
 
 
341 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.54 
 
 
313 aa  269  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3178  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56 
 
 
338 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.965716 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.55 
 
 
313 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.56 
 
 
308 aa  249  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.25 
 
 
314 aa  247  2e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.225843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.17 
 
 
337 aa  245  9e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.63 
 
 
312 aa  242  7e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.05 
 
 
297 aa  238  9e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.42 
 
 
347 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.57 
 
 
297 aa  237  2e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.58 
 
 
311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.65 
 
 
322 aa  236  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.2 
 
 
303 aa  235  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.28 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08780  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.4 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000136527 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.75 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1997  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.83 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.573092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.6 
 
 
301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.96 
 
 
313 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3435  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.56 
 
 
311 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.022663  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0921  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.92 
 
 
296 aa  231  1e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.93 
 
 
312 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.71 
 
 
312 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.91 
 
 
307 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.59 
 
 
313 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.51 
 
 
313 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4816  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.5 
 
 
283 aa  229  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0650  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.45 
 
 
520 aa  229  7e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  44.41 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.41 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.41 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.41 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.19 
 
 
323 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.41 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.15 
 
 
340 aa  227  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.625831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.41 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.41 
 
 
313 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.05 
 
 
316 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.41 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  44.41 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.41 
 
 
313 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.41 
 
 
313 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.41 
 
 
313 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.41 
 
 
313 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.31 
 
 
314 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1976  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.15 
 
 
328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.169238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0963  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.08 
 
 
361 aa  225  8e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0178075 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.65 
 
 
321 aa  225  9e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.9 
 
 
313 aa  225  9e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0753  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.84 
 
 
313 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.09 
 
 
313 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33240  predicted protein  44.83 
 
 
314 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.143284  normal  0.415774 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0678  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.25 
 
 
313 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4161  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.68 
 
 
304 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0840  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.52 
 
 
312 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.97 
 
 
349 aa  222  6e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3819  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.16 
 
 
315 aa  222  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4200  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.22 
 
 
304 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.13 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0559  methyltransferase  44.79 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000972435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3463  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.13 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>