More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2090 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 		 362 aa  713    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  78.53 
 
 		 341 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  81.6 
 
 		 341 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  81.6 
 
 		 341 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  65.19 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  64.79 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  65.77 
 
 		 346 aa  420  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.38 
 
 		 339 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.43 
 
 		 331 aa  374  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.23 
 
 		 332 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.66 
 
 		 337 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.29 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.75 
 
 		 334 aa  321  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.94 
 
 		 345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.01 
 
 		 399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.89 
 
 		 355 aa  308  9e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.45 
 
 		 322 aa  301  8.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.92 
 
 		 331 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.82 
 
 		 353 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.27 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.56 
 
 		 339 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.31 
 
 		 346 aa  293  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.11 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.4 
 
 		 331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.89 
 
 		 331 aa  289  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.22 
 
 		 322 aa  289  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.4 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.04 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.89 
 
 		 326 aa  280  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.14 
 
 		 330 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.62 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.86 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.48 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.95 
 
 		 329 aa  268  8e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.54 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.8 
 
 		 322 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.17 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.25 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.76 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.05 
 
 		 313 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.5 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.02 
 
 		 312 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.16 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.73 
 
 		 313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.01 
 
 		 323 aa  236  7e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.56 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0963  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.23 
 
 		 361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0178075 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.41 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1105  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.21 
 
 		 327 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.38 
 
 		 297 aa  233  5e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0378  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.13 
 
 		 313 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3578  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.81 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3819  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.13 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.45 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4227  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.81 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3461  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.13 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.56 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.51 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.81 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.39 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.48 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.13 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.36 
 
 		 312 aa  230  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3788  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.22 
 
 		 314 aa  229  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0405  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.81 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0393  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.81 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.81 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0419  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.81 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.87 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.27 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1139  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.69 
 
 		 315 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.27 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.27 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.48 
 
 		 313 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.27 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_002978  WD0170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.56 
 
 		 314 aa  227  3e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.225843  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.27 
 
 		 313 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.54 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3812  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.16 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.6 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.625831  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.21 
 
 		 316 aa  225  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  43.95 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.95 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.21 
 
 		 311 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.95 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.95 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  43.95 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.95 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.95 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.95 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.95 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03266  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.92 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00192279  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.83 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.9 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2210  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  48.52 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0172475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.91 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  42.54 
 
 		 349 aa  224  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.9 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.59 
 
 		 314 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>