More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2186 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
330 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  77.74 
 
 
398 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  77.64 
 
 
337 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  78.33 
 
 
332 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  77.85 
 
 
399 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  69.02 
 
 
331 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  76.62 
 
 
332 aa  401  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.38 
 
 
345 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.28 
 
 
351 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.45 
 
 
351 aa  328  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.98 
 
 
353 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.89 
 
 
334 aa  322  4e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.07 
 
 
337 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.03 
 
 
355 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.59 
 
 
346 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.1 
 
 
339 aa  312  3.9999999999999997e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.04 
 
 
353 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.36 
 
 
339 aa  305  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.11 
 
 
329 aa  291  8e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.56 
 
 
347 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.56 
 
 
346 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.14 
 
 
362 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.34 
 
 
331 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.63 
 
 
322 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.17 
 
 
331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.17 
 
 
331 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.87 
 
 
346 aa  287  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.81 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 
326 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.66 
 
 
341 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.97 
 
 
325 aa  280  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.53 
 
 
341 aa  278  7e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.77 
 
 
322 aa  278  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.4 
 
 
322 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.37 
 
 
329 aa  275  9e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.89 
 
 
314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.225843  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.97 
 
 
331 aa  270  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.35 
 
 
341 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.29 
 
 
327 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.24 
 
 
313 aa  255  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.4 
 
 
313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.23 
 
 
301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3178  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.51 
 
 
338 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.965716 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.15 
 
 
297 aa  249  3e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.71 
 
 
312 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.71 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.43 
 
 
337 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.95 
 
 
312 aa  242  7e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0678  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.39 
 
 
313 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0650  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.91 
 
 
520 aa  240  2.9999999999999997e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.44 
 
 
321 aa  239  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0111  methyltransferase  49.68 
 
 
311 aa  239  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0921  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.84 
 
 
296 aa  239  5.999999999999999e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.3 
 
 
308 aa  238  9e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3506  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.62 
 
 
308 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.69 
 
 
303 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.8 
 
 
333 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0454  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.94 
 
 
318 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.91 
 
 
304 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.73 
 
 
316 aa  236  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.9 
 
 
313 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.38 
 
 
349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0628  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.6 
 
 
313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813958  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.76 
 
 
307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2869  methyltransferase  46.62 
 
 
315 aa  235  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.78 
 
 
325 aa  235  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.37 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2502  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.69 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  44.69 
 
 
349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.25 
 
 
313 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.77 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.78 
 
 
313 aa  232  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.47 
 
 
317 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000297627  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.98 
 
 
319 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03266  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.27 
 
 
313 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00192279  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.47 
 
 
317 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  43.67 
 
 
313 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.67 
 
 
313 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.67 
 
 
313 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  43.67 
 
 
313 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.67 
 
 
313 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.67 
 
 
313 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.67 
 
 
313 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.67 
 
 
313 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.67 
 
 
313 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.99 
 
 
313 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.99 
 
 
313 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.99 
 
 
313 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.99 
 
 
313 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1680  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.73 
 
 
294 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.442575  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3527  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.69 
 
 
311 aa  228  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.99 
 
 
313 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.66 
 
 
347 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.65 
 
 
314 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1105  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.22 
 
 
327 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.47 
 
 
313 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.21 
 
 
312 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.79 
 
 
313 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.51 
 
 
340 aa  228  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.625831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>