More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2413 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 		 339 aa  670    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.56 
 
 		 398 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.13 
 
 		 351 aa  348  9e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.81 
 
 		 353 aa  347  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.55 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.42 
 
 		 332 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.62 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.46 
 
 		 351 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.97 
 
 		 326 aa  338  7e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.29 
 
 		 346 aa  336  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.67 
 
 		 339 aa  335  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.69 
 
 		 347 aa  335  9e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.05 
 
 		 353 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.69 
 
 		 346 aa  328  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.54 
 
 		 339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.97 
 
 		 337 aa  325  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.78 
 
 		 334 aa  318  7.999999999999999e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.51 
 
 		 399 aa  315  5e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.51 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.95 
 
 		 341 aa  309  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.04 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.85 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.86 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.86 
 
 		 331 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.18 
 
 		 341 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.55 
 
 		 331 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.66 
 
 		 355 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.1 
 
 		 330 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.49 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.56 
 
 		 362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.9 
 
 		 346 aa  286  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3178  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.3 
 
 		 338 aa  285  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.965716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.54 
 
 		 327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.61 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.18 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.98 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.71 
 
 		 332 aa  277  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.85 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.48 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 		 329 aa  265  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.75 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.225843  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.71 
 
 		 297 aa  264  2e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.19 
 
 		 297 aa  262  6e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.81 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.95 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.56 
 
 		 308 aa  253  5.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.06 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.12 
 
 		 313 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.38 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0921  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.87 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.88 
 
 		 312 aa  242  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.78 
 
 		 313 aa  242  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.08 
 
 		 322 aa  242  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0405  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.13 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.13 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0419  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.13 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0393  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.13 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.75 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.3 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.13 
 
 		 313 aa  239  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.47 
 
 		 313 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1139  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.2 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.48 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.45 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3463  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.56 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.81 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1976  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.81 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.169238  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0378  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.63 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.56 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.48 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.625831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.31 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.54 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3578  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.81 
 
 		 313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3812  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.83 
 
 		 313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.3 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3819  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.48 
 
 		 315 aa  235  8e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.79 
 
 		 319 aa  235  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4227  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.98 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.21 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.59 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3461  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.34 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.39 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3527  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.18 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.51 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.916249  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.9 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0840  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.31 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3435  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.84 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.022663  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2652  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.59 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.88 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  44.13 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.13 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.13 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.13 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.13 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.13 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.13 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0350  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.82 
 
 		 319 aa  227  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.13 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>