More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2015 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
329 aa  665    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  70.38 
 
 
331 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  69.11 
 
 
331 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  69.11 
 
 
331 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.69 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.5 
 
 
322 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  64.89 
 
 
333 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.37 
 
 
345 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.88 
 
 
322 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.72 
 
 
353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.72 
 
 
351 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.46 
 
 
351 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.13 
 
 
332 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.66 
 
 
337 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.46 
 
 
347 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.53 
 
 
353 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.87 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.77 
 
 
346 aa  285  5.999999999999999e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.46 
 
 
346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.3 
 
 
334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.81 
 
 
337 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.78 
 
 
341 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.36 
 
 
346 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.63 
 
 
331 aa  275  9e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.84 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.76 
 
 
322 aa  271  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.69 
 
 
331 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.68 
 
 
326 aa  268  8e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.76 
 
 
355 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.1 
 
 
341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.31 
 
 
325 aa  264  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.14 
 
 
399 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.94 
 
 
329 aa  259  6e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.48 
 
 
339 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.62 
 
 
362 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.48 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.1 
 
 
341 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.77 
 
 
332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1976  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.62 
 
 
328 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.169238  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.98 
 
 
340 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.625831  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.41 
 
 
322 aa  236  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.27 
 
 
313 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.93 
 
 
347 aa  232  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.47 
 
 
297 aa  231  1e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.12 
 
 
337 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.6 
 
 
312 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.99 
 
 
319 aa  226  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2198  methyltransferase  44.77 
 
 
331 aa  225  9e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3178  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.23 
 
 
338 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.965716 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.33 
 
 
297 aa  223  3e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.77 
 
 
313 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.9 
 
 
312 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.28 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0921  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.43 
 
 
296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.19 
 
 
325 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3527  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.35 
 
 
311 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.22 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.73 
 
 
316 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.72 
 
 
313 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.55 
 
 
312 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0163  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.76 
 
 
299 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0366877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0650  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.33 
 
 
520 aa  216  5.9999999999999996e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.31 
 
 
296 aa  215  8e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000346551  normal  0.234872 
 
 
-
 
NC_002978  WD0170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.2 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.225843  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.17 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.15 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4816  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40 
 
 
283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.56 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0350  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.46 
 
 
319 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  43.39 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.39 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.39 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.39 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.39 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.39 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  43.39 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.39 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.39 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
313 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0840  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.58 
 
 
312 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.04 
 
 
311 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.88 
 
 
312 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.52 
 
 
313 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.52 
 
 
313 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.52 
 
 
313 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.52 
 
 
313 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03266  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.67 
 
 
313 aa  209  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00192279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.1 
 
 
303 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0559  methyltransferase  40.76 
 
 
314 aa  209  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000972435  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.85 
 
 
304 aa  209  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.22 
 
 
349 aa  208  8e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  38.89 
 
 
349 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.16 
 
 
308 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0945  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.16 
 
 
308 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.19 
 
 
314 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.85 
 
 
321 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.08 
 
 
314 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1139  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.12 
 
 
315 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148614  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.24 
 
 
349 aa  207  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>