More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3477 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
346 aa  667    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  68.53 
 
 
355 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.47 
 
 
345 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.26 
 
 
332 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.28 
 
 
351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.69 
 
 
353 aa  339  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.24 
 
 
351 aa  338  8e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.13 
 
 
337 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.13 
 
 
331 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.55 
 
 
398 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.06 
 
 
353 aa  319  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.19 
 
 
399 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.11 
 
 
337 aa  315  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.51 
 
 
339 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.58 
 
 
331 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.58 
 
 
331 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.31 
 
 
326 aa  309  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.63 
 
 
331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.89 
 
 
330 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.82 
 
 
332 aa  296  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.63 
 
 
341 aa  295  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.48 
 
 
347 aa  292  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.95 
 
 
334 aa  291  9e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.12 
 
 
341 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.37 
 
 
322 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.55 
 
 
346 aa  289  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.77 
 
 
325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.25 
 
 
327 aa  288  7e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.22 
 
 
339 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.55 
 
 
322 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.89 
 
 
362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.96 
 
 
346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.66 
 
 
329 aa  281  9e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.32 
 
 
339 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.22 
 
 
329 aa  276  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.12 
 
 
341 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.15 
 
 
331 aa  271  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.09 
 
 
322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.62 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.49 
 
 
333 aa  265  8e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.33 
 
 
313 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.68 
 
 
301 aa  256  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.35 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.52 
 
 
297 aa  248  1e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.05 
 
 
322 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.49 
 
 
308 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3435  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.03 
 
 
311 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.022663  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45 
 
 
297 aa  240  2e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3178  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.49 
 
 
338 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.965716 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1139  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.84 
 
 
315 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148614  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.67 
 
 
315 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0111  methyltransferase  50 
 
 
311 aa  238  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.51 
 
 
325 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.18 
 
 
347 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.87 
 
 
313 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.85 
 
 
304 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.2 
 
 
313 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.2 
 
 
319 aa  235  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.37 
 
 
349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4416  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.37 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.87 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.72 
 
 
349 aa  233  3e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3506  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.36 
 
 
308 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.01 
 
 
315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.23 
 
 
312 aa  233  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3812  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.56 
 
 
313 aa  233  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.01 
 
 
315 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0963  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.89 
 
 
361 aa  232  6e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0178075 
 
 
-
 
NC_002978  WD0170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.56 
 
 
314 aa  231  9e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.225843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  43.37 
 
 
349 aa  232  9e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.68 
 
 
315 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.37 
 
 
313 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0936286  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.87 
 
 
316 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0787  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
309 aa  231  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.87 
 
 
313 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.68 
 
 
315 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.54 
 
 
314 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.22 
 
 
323 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.38 
 
 
307 aa  229  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.08 
 
 
313 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.08 
 
 
313 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.08 
 
 
313 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.08 
 
 
313 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.08 
 
 
313 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.55 
 
 
321 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.08 
 
 
313 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  44.76 
 
 
313 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.76 
 
 
313 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.76 
 
 
313 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.14 
 
 
339 aa  226  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0730937  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.76 
 
 
313 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.76 
 
 
313 aa  226  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.76 
 
 
313 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.76 
 
 
313 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0640  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.76 
 
 
313 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.76 
 
 
313 aa  226  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  44.76 
 
 
313 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0753  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.78 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.74 
 
 
313 aa  226  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3819  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.05 
 
 
315 aa  225  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>