More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1889 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 		 325 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  67.95 
 
 		 322 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  67.95 
 
 		 329 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.06 
 
 		 353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.49 
 
 		 353 aa  315  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.18 
 
 		 351 aa  315  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.11 
 
 		 322 aa  314  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.97 
 
 		 332 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.59 
 
 		 331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.31 
 
 		 326 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.33 
 
 		 331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.33 
 
 		 331 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.28 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.37 
 
 		 339 aa  299  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.06 
 
 		 345 aa  298  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.66 
 
 		 398 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.67 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.23 
 
 		 322 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.33 
 
 		 355 aa  292  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.05 
 
 		 339 aa  293  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.05 
 
 		 346 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.55 
 
 		 341 aa  285  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.25 
 
 		 346 aa  285  7e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.59 
 
 		 331 aa  285  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.03 
 
 		 337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.77 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.55 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.95 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.62 
 
 		 329 aa  272  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.8 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.98 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.43 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 		 331 aa  265  7e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.94 
 
 		 327 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3506  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.62 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.1 
 
 		 341 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.77 
 
 		 297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.72 
 
 		 322 aa  246  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.75 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  47 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  47 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.69 
 
 		 313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0111  methyltransferase  51.6 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.69 
 
 		 313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.69 
 
 		 313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.69 
 
 		 313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.94 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.625831  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1976  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.94 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.169238  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0454  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.4 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.93 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.3 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.2 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.38 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.79 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0730937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03266  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.69 
 
 		 313 aa  235  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00192279  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3178  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.33 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.965716 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2502  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.05 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3435  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.59 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.022663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3788  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.37 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.12 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1997  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.49 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.573092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0628  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.74 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813958  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.3 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.06 
 
 		 314 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1991  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.87 
 
 		 307 aa  232  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105239  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0205  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.87 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0840  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.66 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.62 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0753  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0640  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.74 
 
 		 313 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3527  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.31 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.08 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2198  methyltransferase  49.03 
 
 		 331 aa  228  8e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2869  methyltransferase  48.21 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.47 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.58 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.61 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3461  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.32 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0522  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.3 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3637  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.3 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0551  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.3 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.2 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.43 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000297627  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.07 
 
 		 312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.6 
 
 		 315 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1139  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.48 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0069  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.3 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0480  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.62 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.64263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.67 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0455  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.3 
 
 		 313 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>