More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6038 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
331 aa  652    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  99.4 
 
 
331 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  92.75 
 
 
331 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  72.87 
 
 
322 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  69.28 
 
 
327 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  73.68 
 
 
333 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  69.11 
 
 
329 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.68 
 
 
351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.1 
 
 
332 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.65 
 
 
345 aa  315  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.96 
 
 
351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.1 
 
 
337 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.78 
 
 
339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.49 
 
 
339 aa  308  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.87 
 
 
337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.58 
 
 
346 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.47 
 
 
347 aa  301  9e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.78 
 
 
346 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.05 
 
 
353 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.24 
 
 
322 aa  299  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.89 
 
 
398 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.46 
 
 
326 aa  298  8e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.47 
 
 
346 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.4 
 
 
331 aa  298  1e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.33 
 
 
325 aa  295  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.72 
 
 
322 aa  294  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.78 
 
 
334 aa  293  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.49 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.4 
 
 
331 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.86 
 
 
339 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.77 
 
 
399 aa  277  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.43 
 
 
341 aa  272  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.09 
 
 
329 aa  272  6e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.86 
 
 
341 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.4 
 
 
362 aa  269  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.17 
 
 
341 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1976  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.26 
 
 
328 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.169238  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.61 
 
 
340 aa  256  4e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.625831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.75 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.97 
 
 
322 aa  252  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52 
 
 
347 aa  252  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.56 
 
 
330 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.52 
 
 
308 aa  243  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.35 
 
 
313 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.53 
 
 
312 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.91 
 
 
301 aa  239  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.81 
 
 
297 aa  238  1e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.48 
 
 
337 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.83 
 
 
313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.22 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.28 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3178  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.34 
 
 
338 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.965716 
 
 
-
 
NC_002978  WD0170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.56 
 
 
314 aa  231  1e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.225843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03266  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.9 
 
 
313 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00192279  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0840  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.01 
 
 
312 aa  229  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.34 
 
 
313 aa  229  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.52 
 
 
312 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.04 
 
 
313 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  45.36 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.36 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.21 
 
 
313 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.36 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.36 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.21 
 
 
313 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  45.36 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.36 
 
 
313 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.03 
 
 
313 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.36 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.36 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.87 
 
 
313 aa  227  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.21 
 
 
313 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.21 
 
 
313 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.36 
 
 
313 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.01 
 
 
314 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.53 
 
 
313 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0405  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.37 
 
 
313 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.95 
 
 
308 aa  225  6e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0945  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.95 
 
 
308 aa  225  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0419  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.37 
 
 
313 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0393  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.37 
 
 
313 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.37 
 
 
313 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.89 
 
 
313 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3812  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.01 
 
 
313 aa  225  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1991  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.25 
 
 
307 aa  225  9e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105239  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.79 
 
 
307 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.02 
 
 
311 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.2 
 
 
312 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0205  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.92 
 
 
307 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.4 
 
 
303 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0350  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.93 
 
 
319 aa  223  4e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0378  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.37 
 
 
313 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4227  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.37 
 
 
313 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0921  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.76 
 
 
296 aa  222  6e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3578  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.37 
 
 
313 aa  222  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.56 
 
 
313 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.37 
 
 
313 aa  222  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3461  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.49 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0650  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.67 
 
 
520 aa  220  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0628  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.31 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813958  normal  0.404063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>