More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0583 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
322 aa  631  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  72.87 
 
 
331 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  72.87 
 
 
331 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  71.79 
 
 
331 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  70.44 
 
 
327 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.5 
 
 
329 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  64.15 
 
 
333 aa  378  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.41 
 
 
353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.37 
 
 
332 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.73 
 
 
351 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.66 
 
 
337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.19 
 
 
351 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.83 
 
 
339 aa  295  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.55 
 
 
337 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.97 
 
 
398 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.69 
 
 
345 aa  293  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.25 
 
 
322 aa  291  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.94 
 
 
334 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.71 
 
 
326 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.61 
 
 
346 aa  288  6e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.55 
 
 
353 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.7 
 
 
347 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.04 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.23 
 
 
325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 
346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.23 
 
 
346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.11 
 
 
331 aa  282  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.31 
 
 
339 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 
331 aa  273  3e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.39 
 
 
355 aa  269  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.59 
 
 
341 aa  269  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.62 
 
 
399 aa  268  8e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.38 
 
 
322 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.53 
 
 
329 aa  265  8.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.11 
 
 
341 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.79 
 
 
347 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.69 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1976  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.5 
 
 
328 aa  242  5e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.169238  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.48 
 
 
341 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 
322 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.67 
 
 
340 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.625831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3178  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.32 
 
 
338 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.965716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.51 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.8 
 
 
362 aa  238  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43 
 
 
297 aa  233  5e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.81 
 
 
297 aa  232  6e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.48 
 
 
301 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.02 
 
 
312 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.25 
 
 
313 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.25 
 
 
314 aa  228  1e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.225843  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.23 
 
 
313 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.91 
 
 
313 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  45.34 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.34 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.34 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.34 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.34 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.34 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  45.34 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.34 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.34 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.66 
 
 
313 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0840  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.9 
 
 
312 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.31 
 
 
313 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0921  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.33 
 
 
296 aa  223  3e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.26 
 
 
308 aa  223  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45 
 
 
313 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45 
 
 
313 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45 
 
 
313 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45 
 
 
313 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.98 
 
 
321 aa  222  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03266  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.52 
 
 
313 aa  221  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00192279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.56 
 
 
315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.56 
 
 
315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.04 
 
 
319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.56 
 
 
315 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.45 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0936286  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.6 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.18 
 
 
313 aa  219  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.25 
 
 
314 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.23 
 
 
312 aa  219  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0628  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.92 
 
 
313 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813958  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.63 
 
 
313 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3435  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.2 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.022663  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4416  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.25 
 
 
313 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.56 
 
 
315 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.91 
 
 
349 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.81 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0753  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.48 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3527  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.81 
 
 
311 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0350  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.04 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.31 
 
 
313 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.39 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0945  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.39 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.99 
 
 
314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3812  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.99 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0419  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.36 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0405  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.36 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.36 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0393  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.36 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>