More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2474 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
333 aa  655    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  73.68 
 
 
331 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  73.68 
 
 
331 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  73.68 
 
 
331 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  64.89 
 
 
329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  67.61 
 
 
327 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  66.67 
 
 
322 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.46 
 
 
353 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.1 
 
 
351 aa  308  9e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.52 
 
 
351 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.96 
 
 
345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.11 
 
 
339 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.16 
 
 
331 aa  289  4e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.06 
 
 
337 aa  288  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.65 
 
 
332 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.49 
 
 
346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.23 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.15 
 
 
347 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.66 
 
 
353 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.23 
 
 
339 aa  279  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.4 
 
 
337 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.46 
 
 
346 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.15 
 
 
346 aa  275  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
326 aa  272  6e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.42 
 
 
341 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.79 
 
 
398 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.28 
 
 
322 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.75 
 
 
322 aa  261  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
334 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.94 
 
 
341 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
325 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.68 
 
 
355 aa  255  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.25 
 
 
362 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 
329 aa  252  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.12 
 
 
331 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.62 
 
 
341 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.23 
 
 
399 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.8 
 
 
313 aa  232  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.53 
 
 
347 aa  230  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 
322 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.21 
 
 
337 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1976  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.86 
 
 
328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.169238  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.83 
 
 
308 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.88 
 
 
340 aa  222  6e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.625831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.68 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.8 
 
 
330 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3178  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.34 
 
 
338 aa  219  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.965716 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0921  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.76 
 
 
296 aa  218  1e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.94 
 
 
332 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.32 
 
 
313 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.53 
 
 
313 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0753  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.4 
 
 
313 aa  215  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.93 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3196  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.55 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.421638  decreased coverage  0.00000374346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.21 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3788  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.45 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.42 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0350  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.52 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.65 
 
 
313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0419  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.01 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.23 
 
 
308 aa  212  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0945  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.23 
 
 
308 aa  212  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0393  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.01 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0405  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.01 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.01 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.01 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0628  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.11 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813958  normal  0.404063 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  44.86 
 
 
313 aa  212  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.86 
 
 
313 aa  212  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  44.86 
 
 
313 aa  212  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.86 
 
 
313 aa  212  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.07 
 
 
312 aa  212  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.86 
 
 
313 aa  212  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.86 
 
 
313 aa  212  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.86 
 
 
313 aa  212  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.86 
 
 
313 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.86 
 
 
313 aa  212  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.84 
 
 
310 aa  212  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.94 
 
 
314 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.52 
 
 
313 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03266  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.04 
 
 
313 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00192279  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.89 
 
 
314 aa  211  2e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.225843  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.15 
 
 
314 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.67 
 
 
313 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39 
 
 
297 aa  211  2e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.56 
 
 
316 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.79 
 
 
313 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.79 
 
 
313 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.79 
 
 
313 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.79 
 
 
313 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.69 
 
 
313 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.79 
 
 
313 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.32 
 
 
314 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4227  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.34 
 
 
313 aa  209  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.53 
 
 
313 aa  209  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3812  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.67 
 
 
313 aa  209  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2530  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.32 
 
 
332 aa  209  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0378  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.01 
 
 
313 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3578  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.01 
 
 
313 aa  209  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.4 
 
 
297 aa  208  1e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>