238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3989 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4102  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
646 aa  1303    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.246313 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3989  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
646 aa  1303    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.65 
 
 
631 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3789  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.1 
 
 
588 aa  213  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.553704  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2968  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.26 
 
 
704 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.877299  normal  0.682144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1610  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.56 
 
 
707 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.39 
 
 
705 aa  206  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3045  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.67 
 
 
703 aa  206  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267521  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1685  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.05 
 
 
705 aa  203  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05576  serine proteinase  30.67 
 
 
592 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2217  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.66 
 
 
705 aa  185  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001597  putative extracellular serine protease  28.72 
 
 
592 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4488  proprotein convertase P  28.55 
 
 
592 aa  158  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.75 
 
 
862 aa  111  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03583  Kexin like processing proteasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F7]  24.6 
 
 
819 aa  107  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_14973  predicted protein  26.09 
 
 
871 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251561  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.17 
 
 
479 aa  104  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4009  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.42 
 
 
662 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46350  serine peptidase  26.89 
 
 
659 aa  92.8  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.614048  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01120  Kex protein, putative  24.72 
 
 
917 aa  89  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0397465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2140  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.87 
 
 
703 aa  87  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  28.79 
 
 
1006 aa  85.9  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00661  hypothetical protein  25.69 
 
 
1083 aa  80.5  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.464249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  30.58 
 
 
1805 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2634  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.84 
 
 
710 aa  77.4  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.19 
 
 
682 aa  77.4  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12480  subtilisin-like serine protease  27.09 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.998475 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  27.91 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.33 
 
 
487 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  25.89 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  34.2 
 
 
2911 aa  71.2  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  26.36 
 
 
641 aa  70.5  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.71 
 
 
1029 aa  69.3  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0089  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.62 
 
 
368 aa  69.7  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.93 
 
 
627 aa  68.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1837  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.65 
 
 
770 aa  67.8  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00570496  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4661  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.28 
 
 
562 aa  67.8  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  32.94 
 
 
485 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  26.21 
 
 
692 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.94 
 
 
640 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4224  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.61 
 
 
571 aa  66.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2654  serine protease protein  27.04 
 
 
679 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  26.36 
 
 
513 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
1054 aa  65.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2496  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.77 
 
 
575 aa  65.1  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.212596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  25.22 
 
 
298 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2704  serine protease  27.37 
 
 
564 aa  63.9  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0794852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.14 
 
 
500 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.7 
 
 
298 aa  63.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1249  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.02 
 
 
431 aa  62.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1236  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.12 
 
 
570 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0796  serine protease  27.02 
 
 
400 aa  62.4  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.48 
 
 
495 aa  62  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1188  FHA domain-containing protein  27.03 
 
 
541 aa  61.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00110568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3055  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.81 
 
 
483 aa  61.2  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154731  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.33 
 
 
423 aa  60.8  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0861  intracellular serine protease  28.65 
 
 
307 aa  60.1  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000163196  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1039  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.1 
 
 
575 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2951  hypothetical protein  26.02 
 
 
556 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.2 
 
 
579 aa  59.7  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.91 
 
 
510 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02320  subtilisin-like serine protease  37.25 
 
 
591 aa  58.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.81 
 
 
754 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234127  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.68 
 
 
482 aa  57.4  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1582  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.81 
 
 
501 aa  57.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1184  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.55 
 
 
567 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1767  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.69 
 
 
773 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2247  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.45 
 
 
536 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.67 
 
 
498 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.17 
 
 
995 aa  56.2  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2930  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.11 
 
 
453 aa  56.2  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.74 
 
 
721 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00110  extracellular alkaline serine protease  37.08 
 
 
408 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01380  peptidase, putative  30.33 
 
 
950 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19260  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.36 
 
 
443 aa  55.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.775766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3902  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.01 
 
 
583 aa  55.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0147542 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1248  serine metalloprotease MrpA  26.87 
 
 
539 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1417  serine metalloprotease MrpA  25.87 
 
 
560 aa  55.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620558  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0221  serine metalloprotease MrpA  26.87 
 
 
539 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0493  serine metalloprotease MrpA  26.87 
 
 
539 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179342  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1078  serine metalloprotease MrpA  26.87 
 
 
539 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.673556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1050  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.93 
 
 
413 aa  55.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.141106  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2585  peptidase  26.87 
 
 
563 aa  54.7  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1426  putative serine metalloprotease  26.87 
 
 
563 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23258  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1343  putative serine metalloprotease  26.87 
 
 
563 aa  54.7  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.03 
 
 
724 aa  54.3  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2485  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26 
 
 
650 aa  54.3  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0341  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.9 
 
 
627 aa  54.3  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.835088 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2826  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.52 
 
 
718 aa  53.9  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.14 
 
 
1134 aa  53.9  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4620  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.46 
 
 
421 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0849966  hitchhiker  0.0030964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3598  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.77 
 
 
586 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.799906  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  32.3 
 
 
1096 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  27.38 
 
 
606 aa  53.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.23 
 
 
693 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.18 
 
 
648 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.54 
 
 
891 aa  52.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.51 
 
 
1383 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.51 
 
 
320 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3716  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
524 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>