More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2217 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3045  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  71.37 
 
 
703 aa  1043    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267521  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2968  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  74.29 
 
 
704 aa  1085    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.877299  normal  0.682144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1610  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  71.97 
 
 
707 aa  1050    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1685  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  73.31 
 
 
705 aa  1075    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  73.59 
 
 
705 aa  1078    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2217  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
705 aa  1441    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4488  proprotein convertase P  48.48 
 
 
592 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001597  putative extracellular serine protease  46.96 
 
 
592 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05576  serine proteinase  46 
 
 
592 aa  480  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3789  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.28 
 
 
588 aa  280  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.553704  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.36 
 
 
631 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4102  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.43 
 
 
646 aa  201  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.246313 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3989  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.43 
 
 
646 aa  201  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.46 
 
 
862 aa  189  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03583  Kexin like processing proteasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F7]  26.89 
 
 
819 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46350  serine peptidase  28.65 
 
 
659 aa  148  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.614048  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01120  Kex protein, putative  25.55 
 
 
917 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0397465  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00661  hypothetical protein  29.28 
 
 
1083 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.464249 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_14973  predicted protein  25 
 
 
871 aa  127  8.000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251561  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  26.08 
 
 
1805 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2140  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.94 
 
 
703 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4009  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.7 
 
 
662 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  27.62 
 
 
2911 aa  101  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  27.79 
 
 
1096 aa  92.4  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.39 
 
 
835 aa  91.3  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1707  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  35.55 
 
 
737 aa  90.1  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.53 
 
 
836 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2479  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.84 
 
 
769 aa  81.3  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  29.2 
 
 
485 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0861  intracellular serine protease  31.34 
 
 
307 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000163196  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.39 
 
 
1085 aa  78.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.42 
 
 
1029 aa  76.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  25.96 
 
 
513 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.44 
 
 
639 aa  73.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.7 
 
 
487 aa  73.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.42 
 
 
597 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  27.64 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.41 
 
 
510 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2053  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.41 
 
 
777 aa  70.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.120624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.76 
 
 
577 aa  70.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.81 
 
 
640 aa  70.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.86 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  23.64 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3055  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.33 
 
 
483 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  37.25 
 
 
1006 aa  67.8  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3306  intracellular serine protease  25.15 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2496  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.11 
 
 
575 aa  67  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.212596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  25.15 
 
 
315 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1379  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.34 
 
 
641 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863708  normal  0.0771449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.18 
 
 
482 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.62 
 
 
498 aa  67  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1417  serine metalloprotease MrpA  26.58 
 
 
560 aa  67  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.53 
 
 
688 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.2 
 
 
1106 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1859  intracellular serine protease  24.63 
 
 
316 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.749891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1813  intracellular serine protease  24.63 
 
 
316 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2001  intracellular serine protease  24.63 
 
 
316 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3544  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.57 
 
 
711 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2695  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.05 
 
 
438 aa  66.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  27.59 
 
 
818 aa  65.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1248  serine metalloprotease MrpA  26.52 
 
 
539 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.49 
 
 
915 aa  65.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1078  serine metalloprotease MrpA  26.52 
 
 
539 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.673556  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0486  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.51 
 
 
742 aa  65.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.690821  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0221  serine metalloprotease MrpA  26.52 
 
 
539 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1050  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.9 
 
 
413 aa  65.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0493  serine metalloprotease MrpA  26.52 
 
 
539 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  35.21 
 
 
917 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  35.21 
 
 
917 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1944  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.57 
 
 
638 aa  65.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.95 
 
 
1383 aa  65.1  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.51 
 
 
627 aa  64.7  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2585  peptidase  26.26 
 
 
563 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1343  putative serine metalloprotease  26.26 
 
 
563 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1426  putative serine metalloprotease  26.26 
 
 
563 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  25.9 
 
 
397 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2098  intracellular serine protease  23.15 
 
 
316 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  24.33 
 
 
316 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  25.55 
 
 
1154 aa  64.3  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.15 
 
 
682 aa  64.3  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1788  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.49 
 
 
635 aa  63.9  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  34.51 
 
 
917 aa  63.9  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  34.51 
 
 
917 aa  63.9  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  25.75 
 
 
397 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  25.62 
 
 
397 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1829  intracellular serine protease  24.33 
 
 
316 aa  63.9  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  34.51 
 
 
917 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  34.51 
 
 
917 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.77 
 
 
625 aa  63.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.470845  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.2 
 
 
423 aa  63.9  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1864  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.12 
 
 
316 aa  63.9  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.91 
 
 
547 aa  63.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  26.4 
 
 
1156 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.24 
 
 
651 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  34.51 
 
 
917 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4661  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.36 
 
 
562 aa  62.4  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.62 
 
 
1205 aa  62.4  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0245  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.3 
 
 
882 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.983074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.69 
 
 
835 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1596  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.35 
 
 
1262 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>