More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3544 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3544  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
711 aa  1477    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0754  alkaline serine protease  44.67 
 
 
567 aa  336  9e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3587  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.67 
 
 
599 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1626  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.86 
 
 
432 aa  183  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1065  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.48 
 
 
442 aa  154  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0509  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.59 
 
 
412 aa  146  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00169266  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.01 
 
 
327 aa  140  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521678  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1904  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.88 
 
 
548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2930  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.09 
 
 
453 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.22 
 
 
509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.45 
 
 
576 aa  118  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  29.57 
 
 
644 aa  118  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2081  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.34 
 
 
848 aa  109  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1389  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.89 
 
 
585 aa  108  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.94 
 
 
1361 aa  108  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1788  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.12 
 
 
635 aa  107  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.89 
 
 
1060 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.13 
 
 
1234 aa  106  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.242964 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3754  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.88 
 
 
1153 aa  104  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.69 
 
 
1086 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130517  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2457  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.94 
 
 
678 aa  101  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.551982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  29.22 
 
 
1239 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4630  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.51 
 
 
1405 aa  100  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  30.06 
 
 
1285 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.48 
 
 
1106 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0314  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.72 
 
 
1172 aa  99.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.498901  normal  0.380582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1426  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.33 
 
 
1241 aa  98.2  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.123666  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.92 
 
 
1052 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4136  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.39 
 
 
1110 aa  97.8  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  33.55 
 
 
399 aa  97.4  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2246  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.46 
 
 
627 aa  96.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.09 
 
 
1253 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0871  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  30.37 
 
 
1078 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.47 
 
 
726 aa  95.1  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.21 
 
 
370 aa  94.4  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.91 
 
 
640 aa  93.2  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1465  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.7 
 
 
1230 aa  92  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  30 
 
 
1333 aa  92  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.39 
 
 
495 aa  90.9  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3306  intracellular serine protease  27.54 
 
 
315 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151465 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.34 
 
 
452 aa  90.1  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  27.54 
 
 
315 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  26.95 
 
 
316 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1829  intracellular serine protease  27.84 
 
 
316 aa  89.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1859  intracellular serine protease  27.84 
 
 
316 aa  89  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.749891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1813  intracellular serine protease  27.84 
 
 
316 aa  89  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2001  intracellular serine protease  27.84 
 
 
316 aa  89  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.89 
 
 
597 aa  89  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1864  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.95 
 
 
316 aa  89  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2035  intracellular serine protease  27.84 
 
 
316 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2923000000000002e-27 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2657  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.35 
 
 
627 aa  88.2  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  28.21 
 
 
1315 aa  87.8  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  30.13 
 
 
535 aa  87.8  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2098  intracellular serine protease  27.84 
 
 
316 aa  87.4  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  32.39 
 
 
485 aa  87  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.35 
 
 
1261 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791667  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.4 
 
 
653 aa  85.1  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1671  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.66 
 
 
1262 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0114197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1596  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.66 
 
 
1262 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0198  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.42 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.76 
 
 
1078 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  29.2 
 
 
1324 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2620  subtilase family protein  28.92 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1449  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.89 
 
 
446 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1604  hypothetical protein  28.34 
 
 
531 aa  82  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103561  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2937  subtilase family protein  28.57 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.754094  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.92 
 
 
1065 aa  82.4  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0026  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.17 
 
 
823 aa  82  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.21 
 
 
453 aa  82  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2829  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.41 
 
 
999 aa  81.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0476517  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.18 
 
 
805 aa  81.3  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2361  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.12 
 
 
563 aa  80.9  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0874111  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.53 
 
 
1124 aa  80.1  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0058  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.93 
 
 
449 aa  80.1  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  32.34 
 
 
692 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5326  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.02 
 
 
398 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_235  subtilisin-like serine protease precursor  29.29 
 
 
418 aa  80.1  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40456  predicted protein  25.96 
 
 
834 aa  80.5  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  30.45 
 
 
2552 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1566  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.32 
 
 
1191 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.75 
 
 
577 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.66 
 
 
997 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0362893  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.11 
 
 
423 aa  79.7  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1628  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.1 
 
 
1215 aa  79.7  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.279329 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  30.4 
 
 
1407 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  30.4 
 
 
1407 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.51 
 
 
487 aa  79  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  30.4 
 
 
1407 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2868  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.62 
 
 
540 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  28.41 
 
 
1351 aa  79  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  30.4 
 
 
1406 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  29.44 
 
 
1748 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.09 
 
 
558 aa  78.2  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  27.13 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  27.13 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  27.13 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  27.13 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  27.13 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  28.11 
 
 
513 aa  78.2  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.63 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>