283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1610 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3045  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  72.1 
 
 
703 aa  1043    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1610  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
707 aa  1446    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1685  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  96.89 
 
 
705 aa  1401    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2968  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  87.13 
 
 
704 aa  1273    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.877299  normal  0.682144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  95.9 
 
 
705 aa  1384    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2217  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  71.97 
 
 
705 aa  1030    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05576  serine proteinase  46.95 
 
 
592 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4488  proprotein convertase P  47.97 
 
 
592 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001597  putative extracellular serine protease  47.97 
 
 
592 aa  478  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3789  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.24 
 
 
588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.553704  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.38 
 
 
631 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3989  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.39 
 
 
646 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4102  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.39 
 
 
646 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.246313 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.09 
 
 
862 aa  191  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03583  Kexin like processing proteasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F7]  27.87 
 
 
819 aa  160  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46350  serine peptidase  29.44 
 
 
659 aa  144  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.614048  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00661  hypothetical protein  27.33 
 
 
1083 aa  120  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.464249 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01120  Kex protein, putative  25.34 
 
 
917 aa  117  7.999999999999999e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0397465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4009  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.09 
 
 
662 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_14973  predicted protein  25.33 
 
 
871 aa  110  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251561  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2140  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.5 
 
 
703 aa  107  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  25.66 
 
 
1805 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  26.91 
 
 
2911 aa  97.8  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1707  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.51 
 
 
737 aa  97.4  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.8 
 
 
836 aa  94.4  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  29.61 
 
 
1096 aa  89  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  26.26 
 
 
818 aa  87  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.94 
 
 
835 aa  84  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.94 
 
 
835 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  27.54 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.01 
 
 
1085 aa  81.6  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.57 
 
 
1029 aa  76.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.68 
 
 
510 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.6 
 
 
1383 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.54 
 
 
639 aa  75.5  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  26.15 
 
 
513 aa  74.7  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2479  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.64 
 
 
769 aa  74.7  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.18 
 
 
597 aa  71.6  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.16 
 
 
601 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2634  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.62 
 
 
710 aa  68.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1188  FHA domain-containing protein  25.23 
 
 
541 aa  68.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00110568  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.53 
 
 
547 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.32 
 
 
688 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1859  intracellular serine protease  24.83 
 
 
316 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.749891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1813  intracellular serine protease  24.83 
 
 
316 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.25 
 
 
500 aa  66.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2001  intracellular serine protease  24.83 
 
 
316 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0486  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.18 
 
 
742 aa  65.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.690821  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1944  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.21 
 
 
638 aa  65.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  36.42 
 
 
1006 aa  65.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2695  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.17 
 
 
438 aa  65.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  25.17 
 
 
316 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2496  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
575 aa  64.7  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.212596  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0861  intracellular serine protease  31.01 
 
 
307 aa  64.3  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000163196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2098  intracellular serine protease  32.62 
 
 
316 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.01 
 
 
487 aa  64.3  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6479  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.3 
 
 
739 aa  64.3  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  31.65 
 
 
315 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1864  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.51 
 
 
316 aa  64.3  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1829  intracellular serine protease  24.5 
 
 
316 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.32 
 
 
689 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3306  intracellular serine protease  24 
 
 
315 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.39 
 
 
625 aa  63.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.470845  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3055  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.15 
 
 
483 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154731  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.53 
 
 
682 aa  62.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.19 
 
 
651 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.84 
 
 
710 aa  62.4  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196875  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2704  serine protease  26.59 
 
 
564 aa  62  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0794852  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.26 
 
 
498 aa  62  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0298  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.85 
 
 
320 aa  62  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.85 
 
 
320 aa  61.6  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2035  intracellular serine protease  31.91 
 
 
316 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2923000000000002e-27 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1788  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.75 
 
 
635 aa  62  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2053  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.29 
 
 
777 aa  61.6  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.120624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.62 
 
 
482 aa  61.6  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.68 
 
 
479 aa  61.2  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1596  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.74 
 
 
1262 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.2 
 
 
1454 aa  60.8  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.82 
 
 
587 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.07 
 
 
577 aa  60.8  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  26.23 
 
 
297 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  26.8 
 
 
1156 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.17 
 
 
423 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.31 
 
 
583 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  33.12 
 
 
485 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.73 
 
 
495 aa  59.7  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0291  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.85 
 
 
320 aa  59.7  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1379  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
641 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863708  normal  0.0771449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  25.63 
 
 
1154 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.26 
 
 
835 aa  59.7  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1671  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.15 
 
 
1262 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0114197 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.47 
 
 
453 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1388  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.22 
 
 
444 aa  59.3  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.196735  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.6 
 
 
995 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.24 
 
 
612 aa  59.3  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1417  serine metalloprotease MrpA  26.86 
 
 
560 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620558  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0480  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.09 
 
 
431 aa  58.9  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255354  normal  0.124332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0026  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.11 
 
 
823 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.95 
 
 
1054 aa  58.9  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12480  subtilisin-like serine protease  25.29 
 
 
478 aa  58.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.998475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>