280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1656 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2069  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  75.94 
 
 		 561 aa  903    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0990  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.27 
 
 		 561 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2208  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  59.06 
 
 		 551 aa  668    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1015  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  65.95 
 
 		 556 aa  786    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.103701  normal  0.772735 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0824  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  66.49 
 
 		 556 aa  792    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4827  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.94 
 
 		 555 aa  792    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0942  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  71.12 
 
 		 557 aa  842    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1715  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  71.12 
 
 		 581 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4203  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.45 
 
 		 560 aa  658    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1567  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  91.46 
 
 		 562 aa  1075    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1986  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  98.04 
 
 		 561 aa  1143    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1116  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  71.12 
 
 		 557 aa  842    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4310  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.35 
 
 		 566 aa  826    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.744462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1994  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.79 
 
 		 551 aa  672    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0228  FAD dependent oxidoreductase:electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.29 
 
 		 547 aa  654    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1936  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  65.64 
 
 		 548 aa  757    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000473381  normal  0.135998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1262  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  75.8 
 
 		 562 aa  904    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12476  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00995  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  56.65 
 
 		 544 aa  653    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00336804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1869  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  71.12 
 
 		 557 aa  842    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0418968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4118  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.38 
 
 		 554 aa  669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186712  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6919  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.38 
 
 		 556 aa  816    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6873  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.12 
 
 		 557 aa  825    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4606  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.94 
 
 		 557 aa  824    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1386  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.48 
 
 		 557 aa  830    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0158  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  78.23 
 
 		 569 aa  967    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0265  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.18 
 
 		 545 aa  654    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0224484  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1192  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  76.65 
 
 		 561 aa  911    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0282  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.5 
 
 		 555 aa  650    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00443387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1650  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.63 
 
 		 560 aa  660    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2613  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  70.59 
 
 		 557 aa  837    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4100  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.09 
 
 		 549 aa  647    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3527  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.63 
 
 		 554 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1781  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.15 
 
 		 549 aa  637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.420074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3775  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.45 
 
 		 554 aa  659    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2269  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.08 
 
 		 587 aa  812    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.487157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3018  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.08 
 
 		 572 aa  815    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0545377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4163  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.08 
 
 		 572 aa  816    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17400  Electron-transferring-flavoprotein ubiquinone oxidoreductase  55.9 
 
 		 549 aa  651    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1439  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.12 
 
 		 557 aa  825    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2708  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.74 
 
 		 554 aa  660    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.599219 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0725  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.55 
 
 		 549 aa  638    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1895  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  76.11 
 
 		 591 aa  889    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5295  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  77.54 
 
 		 561 aa  899    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1362  electron transferring flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  70.94 
 
 		 557 aa  815    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61271  normal  0.825058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0378  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.12 
 
 		 563 aa  819    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2714  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.49 
 
 		 558 aa  793    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  normal  0.490703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2765  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.48 
 
 		 557 aa  823    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0961  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.45 
 
 		 561 aa  698    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.162811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0929  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.09 
 
 		 561 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.460207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1146  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  76.47 
 
 		 561 aa  911    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0158  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.69 
 
 		 558 aa  801    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5364  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.3 
 
 		 557 aa  827    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.228806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0979  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.12 
 
 		 557 aa  825    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1554  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.3 
 
 		 557 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935108  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5532  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.48 
 
 		 557 aa  829    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1010  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.45 
 
 		 561 aa  698    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.247657  normal  0.301409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15160  electron-transferring-flavoprotein ubiquinone oxido-reductase  58.26 
 
 		 550 aa  663    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561576  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2188  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.9 
 
 		 557 aa  639    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1346  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.12 
 
 		 557 aa  824    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5772  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.48 
 
 		 557 aa  828    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25840  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  59.6 
 
 		 551 aa  672    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252767  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1461  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.12 
 
 		 557 aa  825    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6275  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.3 
 
 		 557 aa  827    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1567  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.41 
 
 		 557 aa  833    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1751  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.23 
 
 		 568 aa  816    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1788  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.48 
 
 		 557 aa  830    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0719  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.55 
 
 		 557 aa  664    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1472  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.15 
 
 		 550 aa  672    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00301285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3139  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.88 
 
 		 568 aa  816    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148772  normal  0.669387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3289  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.45 
 
 		 567 aa  840    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444122  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2679  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  77.18 
 
 		 561 aa  889    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3283  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  76.11 
 
 		 561 aa  879    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.856599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1950  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.88 
 
 		 568 aa  834    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1558  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  71.12 
 
 		 557 aa  842    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000216807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3981  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  65.96 
 
 		 566 aa  798    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0944928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16430  Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.43 
 
 		 549 aa  646    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0960517  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1443  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  76.65 
 
 		 561 aa  889    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.820539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0219  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  71.12 
 
 		 557 aa  842    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1691  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  71.12 
 
 		 581 aa  843    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1656  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.75 
 
 		 545 aa  707    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6767  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.3 
 
 		 557 aa  827    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1656  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  100 
 
 		 561 aa  1161    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.125425  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3523  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.89 
 
 		 550 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1750  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.55 
 
 		 533 aa  629  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.109424 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3686  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.69 
 
 		 553 aa  627  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4453  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  54.25 
 
 		 549 aa  627  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1239  hypothetical protein  54.45 
 
 		 543 aa  625  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1239  hypothetical protein  54.26 
 
 		 543 aa  625  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2147  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.26 
 
 		 549 aa  625  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.962634  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0086  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.16 
 
 		 549 aa  622  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0288135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1956  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.52 
 
 		 610 aa  623  1e-177  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1185  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.7 
 
 		 551 aa  623  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.068389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0272  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.07 
 
 		 549 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000698819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3749  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.07 
 
 		 549 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.986729  normal  0.0743978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0273  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.89 
 
 		 549 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134326  hitchhiker  0.000000385441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2259  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.45 
 
 		 549 aa  619  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.581035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2374  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.35 
 
 		 557 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.694979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0388  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.16 
 
 		 549 aa  618  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1612  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.42 
 
 		 551 aa  617  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2167  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.17 
 
 		 557 aa  616  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.068758  normal  0.0582717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>