290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0929 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0158  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.32 
 
 
569 aa  696    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4827  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.8 
 
 
555 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0942  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.64 
 
 
557 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1691  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.64 
 
 
581 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1567  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.71 
 
 
562 aa  699    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1116  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  53.64 
 
 
557 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0990  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  99.82 
 
 
561 aa  1154    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1656  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.09 
 
 
561 aa  695    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.125425  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1936  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54 
 
 
548 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000473381  normal  0.135998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1262  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58 
 
 
562 aa  711    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12476  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1869  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.64 
 
 
557 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0418968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2069  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.64 
 
 
561 aa  692    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388318 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2613  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.27 
 
 
557 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0158  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.83 
 
 
558 aa  684    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4310  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.7 
 
 
566 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.744462  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1895  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.55 
 
 
591 aa  669    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5295  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.15 
 
 
561 aa  656    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175772  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1010  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  99.64 
 
 
561 aa  1152    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.247657  normal  0.301409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1146  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.36 
 
 
561 aa  712    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0276165  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1986  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.27 
 
 
561 aa  696    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1015  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.45 
 
 
556 aa  640    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.103701  normal  0.772735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0961  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  99.47 
 
 
561 aa  1150    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.162811  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0929  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  100 
 
 
561 aa  1155    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.460207  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3289  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.1 
 
 
567 aa  655    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444122  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0824  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.45 
 
 
556 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1715  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.64 
 
 
581 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1788  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.09 
 
 
557 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3139  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.44 
 
 
568 aa  654    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148772  normal  0.669387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1567  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.55 
 
 
557 aa  641    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2679  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.27 
 
 
561 aa  674    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3283  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.09 
 
 
561 aa  672    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.856599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1950  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.04 
 
 
568 aa  668    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1192  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.27 
 
 
561 aa  692    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1558  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.64 
 
 
557 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000216807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3981  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.41 
 
 
566 aa  635    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0944928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1443  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.36 
 
 
561 aa  670    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.820539  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0219  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.64 
 
 
557 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1751  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.04 
 
 
568 aa  648    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6873  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.55 
 
 
557 aa  633  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100379  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4606  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.55 
 
 
557 aa  634  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142327  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5532  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.55 
 
 
557 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1439  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.36 
 
 
557 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6767  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.18 
 
 
557 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0979  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.36 
 
 
557 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1554  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.36 
 
 
557 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935108  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1346  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.55 
 
 
557 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1461  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.36 
 
 
557 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6275  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.36 
 
 
557 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6919  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.36 
 
 
556 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5364  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.91 
 
 
557 aa  633  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.228806 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1386  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.18 
 
 
557 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3018  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.1 
 
 
572 aa  630  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0545377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4163  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.1 
 
 
572 aa  631  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5772  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.18 
 
 
557 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2269  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.06 
 
 
587 aa  626  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.487157  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1472  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.35 
 
 
550 aa  624  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00301285  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1362  electron transferring flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.82 
 
 
557 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61271  normal  0.825058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2714  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.5 
 
 
558 aa  618  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  normal  0.490703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2765  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.45 
 
 
557 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126018  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0265  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.45 
 
 
545 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0224484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0378  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.45 
 
 
563 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1656  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.26 
 
 
545 aa  605  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0725  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.72 
 
 
549 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17400  Electron-transferring-flavoprotein ubiquinone oxidoreductase  51.63 
 
 
549 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348263  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16430  Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  51.45 
 
 
549 aa  598  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0960517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4453  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  51.09 
 
 
549 aa  597  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1994  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.44 
 
 
551 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0228  FAD dependent oxidoreductase:electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  52 
 
 
547 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0282  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.69 
 
 
555 aa  594  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00443387  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1612  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.53 
 
 
551 aa  592  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249988  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0719  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.63 
 
 
557 aa  592  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136312  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0276  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50.36 
 
 
549 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4203  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.79 
 
 
560 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1239  hypothetical protein  52.9 
 
 
543 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4118  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  51.35 
 
 
554 aa  590  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186712  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0388  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50.36 
 
 
549 aa  588  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817996  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000406  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  52.27 
 
 
540 aa  589  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.453642  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0272  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50.72 
 
 
549 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3749  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50.72 
 
 
549 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.986729  normal  0.0743978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0273  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  50.72 
 
 
549 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134326  hitchhiker  0.000000385441 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0283  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50.36 
 
 
549 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3775  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.61 
 
 
554 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3686  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  51.35 
 
 
553 aa  587  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1239  hypothetical protein  52.54 
 
 
543 aa  586  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0284  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50.18 
 
 
549 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1650  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.61 
 
 
560 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0280  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50.18 
 
 
549 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00995  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  50.73 
 
 
544 aa  585  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00336804  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1988  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.44 
 
 
545 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.964915  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2188  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50.54 
 
 
557 aa  585  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2259  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.91 
 
 
549 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.581035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3527  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.62 
 
 
554 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2708  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.42 
 
 
554 aa  578  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.599219 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0086  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50.72 
 
 
549 aa  581  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0288135  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25840  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  52.62 
 
 
551 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252767  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1750  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50.27 
 
 
533 aa  578  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.109424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3523  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50.72 
 
 
550 aa  581  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2208  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  52.26 
 
 
551 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4403  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50.36 
 
 
549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273823 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4794  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50.18 
 
 
549 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0795464  hitchhiker  0.00000316317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>