18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2050 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2050  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  490  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3526  hypothetical protein  76.95 
 
 		 240 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3884  hypothetical protein  60.42 
 
 		 242 aa  305  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035033  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1368  hypothetical protein  42.86 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0029518  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1029  hypothetical protein  43.86 
 
 		 241 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0947  hypothetical protein  43.17 
 
 		 241 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0724  hypothetical protein  40.45 
 
 		 229 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480044  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1563  hypothetical protein  31.84 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00766296  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2393  hypothetical protein  29.33 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2976  hypothetical protein  28.81 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0640224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0263  hypothetical protein  25.62 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4287  putative secreted protein  27.43 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4427  hypothetical protein  27.43 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0113  putative secreted protein  27.43 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6790  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  26.58 
 
 		 237 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2281  hypothetical protein  35.94 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5330  hypothetical protein  34.41 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1309  hypothetical protein  35.94 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>