15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3884 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3884  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035033  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3526  hypothetical protein  61.41 
 
 		 240 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2050  hypothetical protein  61.23 
 
 		 244 aa  294  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1368  hypothetical protein  44.13 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0029518  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0947  hypothetical protein  42.11 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1029  hypothetical protein  42.11 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0724  hypothetical protein  39.82 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480044  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2393  hypothetical protein  31.55 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1563  hypothetical protein  30 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00766296  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03813  hypothetical protein  24.5 
 
 		 309 aa  49.7  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2976  hypothetical protein  27.16 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0640224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2281  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4427  hypothetical protein  25.75 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4287  putative secreted protein  25.32 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0113  putative secreted protein  26.61 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>