17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1563 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1563  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  436  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00766296  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0947  hypothetical protein  32.84 
 
 
241 aa  89.4  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1029  hypothetical protein  31.47 
 
 
241 aa  88.2  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3526  hypothetical protein  32 
 
 
240 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0724  hypothetical protein  26.73 
 
 
229 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480044  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2050  hypothetical protein  31.84 
 
 
244 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3884  hypothetical protein  30 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035033  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1368  hypothetical protein  30.05 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0029518  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2393  hypothetical protein  30.05 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4427  hypothetical protein  25.56 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4287  putative secreted protein  25.56 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0113  putative secreted protein  25.56 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2281  hypothetical protein  38.36 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2976  hypothetical protein  26.25 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0640224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03813  hypothetical protein  27.64 
 
 
309 aa  53.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5330  hypothetical protein  28.18 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6790  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  24.54 
 
 
237 aa  41.6  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43994  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>