21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3526 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3526  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2050  hypothetical protein  77.09 
 
 
244 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3884  hypothetical protein  61.41 
 
 
242 aa  311  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035033  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1368  hypothetical protein  43.84 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0029518  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0947  hypothetical protein  41.74 
 
 
241 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1029  hypothetical protein  41.74 
 
 
241 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0724  hypothetical protein  39.09 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480044  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2393  hypothetical protein  30.26 
 
 
219 aa  98.6  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1563  hypothetical protein  32 
 
 
211 aa  82  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00766296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2976  hypothetical protein  27.47 
 
 
232 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0640224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0263  hypothetical protein  24.69 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4287  putative secreted protein  27.68 
 
 
213 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4427  hypothetical protein  27.68 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0113  putative secreted protein  27.68 
 
 
213 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2281  hypothetical protein  23.47 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03813  hypothetical protein  29.59 
 
 
309 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5330  hypothetical protein  36.36 
 
 
210 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6790  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  23.85 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43994  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0783  polyferredoxin-like protein  26.55 
 
 
336 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1146  hypothetical protein  22.08 
 
 
241 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409017  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1309  hypothetical protein  31.75 
 
 
238 aa  42  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718075  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>