16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2281 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2281  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  488  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1309  hypothetical protein  38.46 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718075  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0263  hypothetical protein  38.4 
 
 
237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2976  hypothetical protein  38.56 
 
 
232 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0640224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1146  hypothetical protein  29.52 
 
 
241 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409017  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6790  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  27.56 
 
 
237 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43994  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2393  hypothetical protein  23.41 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1029  hypothetical protein  41.94 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0947  hypothetical protein  41.94 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1368  hypothetical protein  37.8 
 
 
242 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0029518  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1639  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  22.66 
 
 
314 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1563  hypothetical protein  38.36 
 
 
211 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00766296  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3526  hypothetical protein  23.47 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3884  hypothetical protein  25 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035033  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0724  hypothetical protein  33.85 
 
 
229 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480044  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2050  hypothetical protein  35.94 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>