13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1309 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1309  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0263  hypothetical protein  44.87 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2281  hypothetical protein  38.46 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1146  hypothetical protein  37.05 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2976  hypothetical protein  32.78 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0640224 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1639  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  26.26 
 
 		 314 aa  52.8  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1029  hypothetical protein  38.46 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0947  hypothetical protein  38.46 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1368  hypothetical protein  31.03 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0029518  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2393  hypothetical protein  39.62 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6790  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  22.42 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2050  hypothetical protein  35.94 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3526  hypothetical protein  31.75 
 
 		 240 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.769555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>