16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6790 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6790  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  100 
 
 		 237 aa  485  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2281  hypothetical protein  28.33 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1146  hypothetical protein  26.67 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0263  hypothetical protein  27.94 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2976  hypothetical protein  25.75 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0640224 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1639  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  27.46 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2050  hypothetical protein  26.69 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2393  hypothetical protein  24 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3526  hypothetical protein  23.85 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1029  hypothetical protein  33.7 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0947  hypothetical protein  33.7 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1309  hypothetical protein  22.42 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0724  hypothetical protein  24.14 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480044  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  25.2 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1368  hypothetical protein  27.15 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0029518  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1563  hypothetical protein  24.26 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00766296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>